More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04180 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1248    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  47.94 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  36.12 
 
 		 549 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  35.68 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  35.69 
 
 		 532 aa  340  4e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  33.33 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  55.61 
 
 		 486 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  49.63 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  52.4 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.79 
 
 		 502 aa  257  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  53.48 
 
 		 497 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  53.04 
 
 		 497 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  48.46 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  52.61 
 
 		 497 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.49 
 
 		 504 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  52.19 
 
 		 497 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  48.57 
 
 		 474 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  47.74 
 
 		 497 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  49.62 
 
 		 491 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  49.57 
 
 		 498 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  52.94 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  48.22 
 
 		 496 aa  243  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  47.83 
 
 		 544 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  45.96 
 
 		 496 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  45.96 
 
 		 496 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  52.04 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  50 
 
 		 496 aa  241  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  45.66 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  53.24 
 
 		 496 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  50.66 
 
 		 494 aa  237  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.77 
 
 		 497 aa  236  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.58 
 
 		 501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  50 
 
 		 490 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  52.45 
 
 		 494 aa  232  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  46.77 
 
 		 493 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.71 
 
 		 499 aa  231  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  46.72 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  47.06 
 
 		 492 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.23 
 
 		 267 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.23 
 
 		 267 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  51.82 
 
 		 494 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  49.32 
 
 		 270 aa  226  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.09 
 
 		 270 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.09 
 
 		 270 aa  226  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  48.09 
 
 		 270 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  46.75 
 
 		 495 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  48.09 
 
 		 270 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  48.07 
 
 		 270 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  47.66 
 
 		 254 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  47.66 
 
 		 254 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  46.72 
 
 		 288 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  43.85 
 
 		 308 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  48.02 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  47.48 
 
 		 259 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  54.04 
 
 		 264 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  46.35 
 
 		 496 aa  216  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  49.28 
 
 		 270 aa  216  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  51.04 
 
 		 556 aa  213  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  45.87 
 
 		 258 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.71 
 
 		 551 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  47.92 
 
 		 521 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  45.37 
 
 		 261 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  48.61 
 
 		 263 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  41.47 
 
 		 279 aa  180  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  40.53 
 
 		 405 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  40.19 
 
 		 263 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  41.33 
 
 		 318 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.09 
 
 		 328 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  38.67 
 
 		 369 aa  164  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3630  hypothetical protein  42.23 
 
 		 305 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0975997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  40.87 
 
 		 280 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  39.47 
 
 		 310 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  40.87 
 
 		 280 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  36.54 
 
 		 314 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  38.36 
 
 		 304 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  38.33 
 
 		 375 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  40.53 
 
 		 304 aa  160  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  39.09 
 
 		 305 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  40 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  36.55 
 
 		 289 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2173  hypothetical protein  38.94 
 
 		 270 aa  157  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0631344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  40.19 
 
 		 337 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  40.78 
 
 		 324 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  31.58 
 
 		 365 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  41.51 
 
 		 305 aa  157  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  36.32 
 
 		 314 aa  157  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  39.42 
 
 		 305 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  40.57 
 
 		 364 aa  157  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  38.14 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  38.14 
 
 		 271 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  39.72 
 
 		 359 aa  156  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  36.89 
 
 		 274 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  38.91 
 
 		 320 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  37.21 
 
 		 309 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  39.55 
 
 		 296 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  37.29 
 
 		 301 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0877  hypothetical protein  39.42 
 
 		 277 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  38.67 
 
 		 324 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3368  hypothetical protein  34.93 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275046 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  39.27 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>