More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0044 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  67.19 
 
 		 263 aa  353  2e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  52.53 
 
 		 497 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  45.68 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  49.15 
 
 		 308 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  50 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  51.85 
 
 		 494 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  51.15 
 
 		 493 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  49.32 
 
 		 491 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  49.31 
 
 		 496 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  49.31 
 
 		 496 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  50 
 
 		 501 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.68 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.25 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  48.25 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.25 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  48.25 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  48.25 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  48.25 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  48.25 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  50.44 
 
 		 549 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  51.14 
 
 		 496 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  47.81 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.77 
 
 		 497 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  49.31 
 
 		 496 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  47.96 
 
 		 486 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  49.54 
 
 		 532 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  49.07 
 
 		 535 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  47.93 
 
 		 498 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  47.49 
 
 		 495 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.09 
 
 		 551 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  48.39 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.81 
 
 		 497 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  45.92 
 
 		 496 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  46.33 
 
 		 498 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  46.06 
 
 		 556 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  47 
 
 		 544 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  48.29 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  45.66 
 
 		 474 aa  205  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  47.25 
 
 		 498 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.62 
 
 		 534 aa  205  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  53.72 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  45.62 
 
 		 490 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  47.25 
 
 		 497 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.47 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  46.75 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  47.22 
 
 		 578 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  49.04 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  46.79 
 
 		 497 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  45 
 
 		 490 aa  202  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  46.79 
 
 		 497 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.39 
 
 		 499 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.58 
 
 		 502 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  46.33 
 
 		 497 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  45.37 
 
 		 609 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  46.29 
 
 		 496 aa  198  7e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  46.82 
 
 		 494 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  44.95 
 
 		 549 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  46.3 
 
 		 494 aa  192  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  41.98 
 
 		 556 aa  191  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  44.75 
 
 		 492 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  42.18 
 
 		 492 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5190  hypothetical protein  39.44 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19577  normal  0.463568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  47.03 
 
 		 521 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3879  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0750  hypothetical protein  39.07 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  36.93 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  36.89 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3709  hypothetical protein  37.19 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.557269  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  39.35 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  40.09 
 
 		 307 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  37.71 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  37.7 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  40.28 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0262  hypothetical protein  35.54 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.322774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14980  hypothetical protein  37.12 
 
 		 305 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0712  hypothetical protein  37.21 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  38.05 
 
 		 258 aa  158  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  37.67 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0746  hypothetical protein  37.21 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  38.84 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  40 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  38.02 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  35.37 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.37 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  35.27 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  35.56 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  39.91 
 
 		 310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  35.53 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4042  protein of unknown function DUF344  37.5 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  37.21 
 
 		 359 aa  154  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  40.17 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5283  hypothetical protein  35.56 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  39.82 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  35.65 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  39.63 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  37.96 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2051  hypothetical protein  37.55 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.699312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1416  hypothetical protein  36.4 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0078754  normal  0.193293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>