More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1635 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  86.74 
 
 
290 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  54.26 
 
 
348 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  56.43 
 
 
328 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  56.43 
 
 
334 aa  288  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  52.71 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  55.19 
 
 
330 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.03 
 
 
278 aa  276  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  53.11 
 
 
318 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  52.02 
 
 
268 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.1 
 
 
280 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  54.17 
 
 
282 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  53.75 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  51.56 
 
 
281 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  48.25 
 
 
293 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  49.6 
 
 
357 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  55.66 
 
 
307 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  48.57 
 
 
447 aa  255  6e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.95 
 
 
299 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  46.13 
 
 
284 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  47.33 
 
 
284 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  49.21 
 
 
278 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  44.41 
 
 
299 aa  245  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  50.21 
 
 
275 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  50.2 
 
 
291 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  50.42 
 
 
288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  50.2 
 
 
283 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.06 
 
 
276 aa  241  7e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  49.79 
 
 
275 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  47.81 
 
 
279 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  46.94 
 
 
286 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  50.85 
 
 
279 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  49.25 
 
 
284 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  50.85 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  51.54 
 
 
279 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.97 
 
 
289 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  50.42 
 
 
279 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  49.4 
 
 
288 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  49.4 
 
 
288 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  52.83 
 
 
304 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.36 
 
 
305 aa  235  8e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  49 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  49.37 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  46.12 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  49.59 
 
 
269 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  49.17 
 
 
268 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  40.81 
 
 
286 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  49.58 
 
 
279 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  49.58 
 
 
279 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  49.58 
 
 
279 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  46.34 
 
 
279 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  50.23 
 
 
275 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  44.77 
 
 
317 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  45.78 
 
 
328 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  49.34 
 
 
279 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.36 
 
 
269 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.97 
 
 
308 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  45.77 
 
 
289 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  45.11 
 
 
308 aa  225  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  46.99 
 
 
305 aa  225  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  45.3 
 
 
338 aa  224  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  46.1 
 
 
347 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  50.92 
 
 
290 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  44.58 
 
 
248 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  47.95 
 
 
292 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  46.09 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  44.13 
 
 
357 aa  219  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  47.35 
 
 
289 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.37 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  45.95 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  46.38 
 
 
303 aa  217  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  47.84 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  44.57 
 
 
294 aa  215  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  41.48 
 
 
292 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  46.98 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  47.68 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  47.68 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  44.11 
 
 
296 aa  211  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  46.98 
 
 
289 aa  211  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  47.03 
 
 
295 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  46.98 
 
 
296 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  42.5 
 
 
292 aa  209  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  42.86 
 
 
290 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  42.52 
 
 
300 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  42.86 
 
 
290 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  44.26 
 
 
303 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  44.17 
 
 
292 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  44.54 
 
 
290 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.89 
 
 
292 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  47.25 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  45.16 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  45.11 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.96 
 
 
284 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  43.53 
 
 
314 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>