More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0152 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  75.09 
 
 		 269 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  65.17 
 
 		 275 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  62.92 
 
 		 275 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  62.17 
 
 		 275 aa  355  5e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  58.82 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  59.53 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  57.72 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  57.72 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  56.62 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  57.35 
 
 		 279 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  57.35 
 
 		 279 aa  329  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  56.25 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  53.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  53.48 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  56.64 
 
 		 278 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  55.08 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  52.75 
 
 		 279 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  56.3 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  54.47 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  54.3 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  53.49 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  52.11 
 
 		 268 aa  288  9e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.44 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  51.95 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  52.9 
 
 		 314 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  53.36 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.39 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  50.75 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  49.81 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  48.47 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  48.67 
 
 		 348 aa  258  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  48.65 
 
 		 266 aa  258  7e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  48.09 
 
 		 328 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  48.09 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  45.49 
 
 		 447 aa  249  3e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  49.02 
 
 		 318 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.22 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  46.59 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  45.21 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  48.36 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  47.52 
 
 		 290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  43.51 
 
 		 284 aa  232  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  46.75 
 
 		 283 aa  231  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  41.51 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  47.09 
 
 		 281 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  45.24 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  43.53 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  46.72 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  42.57 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  42.12 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  43.19 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  43.2 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  39.01 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  42.12 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.46 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  39.71 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  42.32 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  43.01 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.36 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  45.49 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  42.68 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  41.04 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  42.49 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  38.99 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  40.15 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  45.06 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  43.35 
 
 		 328 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  40.23 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  44.69 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  43.97 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  41.02 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  40.07 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.78 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.78 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  42.91 
 
 		 290 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  45.26 
 
 		 300 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  43.1 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  41.33 
 
 		 292 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  40.07 
 
 		 286 aa  201  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  38.04 
 
 		 289 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  44.49 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  39.22 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  41.24 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  41.43 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  38.32 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.42 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  42.17 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  42.99 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.95 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  41.78 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.54 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>