More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3289 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  62.21 
 
 
268 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  57.04 
 
 
279 aa  308  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  57.75 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  58.75 
 
 
279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  57.81 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  59.04 
 
 
278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  59.36 
 
 
305 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  59.36 
 
 
305 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  57.42 
 
 
275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  56.83 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  58.59 
 
 
275 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  56.15 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  58.85 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  56.15 
 
 
279 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  56.54 
 
 
279 aa  299  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  56.54 
 
 
279 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  55.77 
 
 
279 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  55.77 
 
 
279 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  58.89 
 
 
303 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  52.59 
 
 
279 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  55.51 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  53.76 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  54.44 
 
 
269 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.44 
 
 
269 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  51.72 
 
 
297 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.94 
 
 
280 aa  261  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  52.57 
 
 
269 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  50.19 
 
 
268 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  46.24 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  49.59 
 
 
283 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  49.06 
 
 
282 aa  241  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  49.82 
 
 
266 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  52.26 
 
 
290 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  46.84 
 
 
357 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  45.66 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.63 
 
 
278 aa  232  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  47.04 
 
 
307 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  42.37 
 
 
447 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  47.13 
 
 
282 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.34 
 
 
284 aa  219  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  46.48 
 
 
281 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  45.9 
 
 
347 aa  218  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  48.06 
 
 
305 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  44.71 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  47.86 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  47.69 
 
 
348 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  41.54 
 
 
357 aa  216  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  46.51 
 
 
316 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  43.51 
 
 
284 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  45.72 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  43.48 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  46.69 
 
 
370 aa  211  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  52.44 
 
 
330 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  46.01 
 
 
318 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  47.83 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  42.91 
 
 
317 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  43.14 
 
 
291 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  42.4 
 
 
248 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.46 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  42.47 
 
 
288 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  42.47 
 
 
288 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  42.47 
 
 
288 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  42.35 
 
 
308 aa  198  9e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  43.66 
 
 
304 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.77 
 
 
305 aa  195  6e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  42.91 
 
 
303 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  38.72 
 
 
295 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.6 
 
 
299 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  39.55 
 
 
293 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  42.34 
 
 
328 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  40.91 
 
 
296 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  38.83 
 
 
289 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  41.11 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  37.13 
 
 
297 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  42.26 
 
 
290 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  42.36 
 
 
292 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  38.24 
 
 
299 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  38.2 
 
 
286 aa  185  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  40 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  41.15 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.21 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  37.69 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  38.1 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  38.01 
 
 
289 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  38.08 
 
 
289 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  35.27 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  37.59 
 
 
294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  38.08 
 
 
294 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  42.73 
 
 
300 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  40.43 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  38.86 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  39.91 
 
 
294 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  38.19 
 
 
303 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>