More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6064 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 		 308 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  71.43 
 
 		 328 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  70.86 
 
 		 338 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.86 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  51.71 
 
 		 289 aa  305  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  50.85 
 
 		 304 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  48.64 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  48.77 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  50.18 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  48.29 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  54.44 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  48.81 
 
 		 293 aa  298  8e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  48.58 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  46.58 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  48.58 
 
 		 290 aa  288  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  46.39 
 
 		 297 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  47.54 
 
 		 295 aa  288  9e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  47.52 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  48.95 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  44.26 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  48.93 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  50.99 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  50.19 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.48 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  49.61 
 
 		 304 aa  271  9e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  51.84 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  45.36 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  45.36 
 
 		 289 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  47.01 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.28 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.52 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  47.23 
 
 		 292 aa  255  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  43.01 
 
 		 292 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  43.88 
 
 		 293 aa  252  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  45.71 
 
 		 334 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  46.48 
 
 		 316 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  46.4 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  45.36 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  41.7 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.97 
 
 		 278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  42.52 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  44.49 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  44.49 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  47.11 
 
 		 330 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  44.06 
 
 		 266 aa  234  9e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  45.83 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.86 
 
 		 280 aa  228  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  41.97 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  41.06 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  43.27 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  38.6 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  44.25 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  42.04 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  41.06 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  42.04 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  42.04 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  44.4 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  41.22 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  42.28 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  41.46 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  39.86 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  42.74 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  41.8 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  41.94 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  38.35 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  37.76 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  38.37 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  38.52 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  41.7 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  37.97 
 
 		 275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  40.66 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  42.22 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  41.22 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  41.22 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  41.25 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  39.02 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  39.59 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  38.27 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  37.6 
 
 		 248 aa  192  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  39.59 
 
 		 279 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  39.34 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  36.5 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  40.41 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  38.3 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  38.11 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  38.11 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.54 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  38.93 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  40.61 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  38.69 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  39.59 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  39.59 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>