More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1024 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  87.54 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  83.04 
 
 		 289 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  67.82 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  67.94 
 
 		 297 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  64.36 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  66.67 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  65.03 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  65.05 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  64.71 
 
 		 290 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  65.71 
 
 		 294 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  64.34 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  60.42 
 
 		 292 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  61.67 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  60.84 
 
 		 294 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  53.98 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  56.1 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  55.47 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.82 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  49.47 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  48.94 
 
 		 293 aa  295  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.75 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  51.79 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.2 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  53.88 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.43 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  49.48 
 
 		 338 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  48.83 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  50.18 
 
 		 304 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.07 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  46.39 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  42.76 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  48.43 
 
 		 289 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.73 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  46.86 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.18 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  43.94 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  46.89 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  47.84 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  38.97 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  41.95 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  46.25 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  41.57 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  43.77 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  46.67 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  46.28 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  44.83 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  41.51 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  47.64 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  47.64 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  41.57 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  48.12 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  43.28 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  45.38 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  40.82 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  40.82 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  45.83 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  44.4 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  40.75 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  44 
 
 		 447 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  41.87 
 
 		 357 aa  211  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  42.26 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  40.07 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  43.58 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  41.9 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  40.78 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  41.7 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  39.16 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  40.7 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  39.93 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  40.71 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  40.67 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  41.9 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  38.65 
 
 		 357 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  40.49 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.93 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  38.49 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  41.13 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.04 
 
 		 269 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  40.89 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  40.89 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  40.89 
 
 		 288 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  41.05 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  38.61 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  40.66 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  39.15 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  38.17 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  38.64 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.01 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  38.75 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  38.2 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>