More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5338 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  62.12 
 
 
297 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  50.88 
 
 
294 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  49.49 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  50.18 
 
 
295 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  50.35 
 
 
289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  48.6 
 
 
297 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  49.47 
 
 
289 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  50.89 
 
 
303 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  48.06 
 
 
290 aa  294  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  50.53 
 
 
296 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  48.73 
 
 
292 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  48.59 
 
 
294 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  47 
 
 
290 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
294 aa  292  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  47.52 
 
 
290 aa  292  5e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  48.56 
 
 
289 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  49.28 
 
 
294 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.03 
 
 
292 aa  281  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  45.86 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  45.77 
 
 
286 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  46.4 
 
 
328 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.81 
 
 
289 aa  261  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  46.4 
 
 
338 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.39 
 
 
299 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  47.22 
 
 
299 aa  259  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.88 
 
 
308 aa  252  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48 
 
 
305 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  48.16 
 
 
293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  43.96 
 
 
289 aa  235  7e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  45.39 
 
 
300 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  45.39 
 
 
292 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  41.73 
 
 
292 aa  223  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  46.56 
 
 
304 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  46.05 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  44.67 
 
 
316 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  41.7 
 
 
304 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  42.59 
 
 
318 aa  212  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  43.87 
 
 
266 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  43.5 
 
 
328 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.91 
 
 
280 aa  205  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  43.28 
 
 
348 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.63 
 
 
278 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  43.15 
 
 
334 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  40.65 
 
 
275 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  40.93 
 
 
275 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  40.93 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  43.4 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  41.87 
 
 
330 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  39.09 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  42.13 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  39.92 
 
 
268 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  40.52 
 
 
279 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  40.09 
 
 
279 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  43.48 
 
 
281 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  39.83 
 
 
279 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  41.56 
 
 
282 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  42.61 
 
 
269 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  41.7 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  38.27 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  39.41 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  39.02 
 
 
279 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  39.02 
 
 
279 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  39.58 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  40 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  39.57 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  37.76 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  39.58 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  37 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  44.04 
 
 
307 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  39.32 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.13 
 
 
269 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.81 
 
 
269 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  38.77 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  38.89 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  39.66 
 
 
279 aa  178  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  40.43 
 
 
283 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  40.43 
 
 
288 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  38.52 
 
 
284 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  37.4 
 
 
279 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  38.75 
 
 
295 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  39.13 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  39.18 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  38.02 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  36.94 
 
 
303 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  37.19 
 
 
288 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  37.19 
 
 
288 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  37.19 
 
 
288 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  37.45 
 
 
317 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  37.07 
 
 
314 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  36.51 
 
 
357 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  36.63 
 
 
248 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>