More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0040 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  100 
 
 		 275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  99.27 
 
 		 275 aa  567  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  78.55 
 
 		 275 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  61.94 
 
 		 269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  59.07 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  62.17 
 
 		 269 aa  340  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  56.83 
 
 		 279 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  58.91 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  57.19 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  55.64 
 
 		 278 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  57.75 
 
 		 279 aa  327  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  55.98 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  55.98 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  57.75 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  58.43 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  57.36 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  57.36 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  54.72 
 
 		 279 aa  315  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  54.18 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.42 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  56.92 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  57.48 
 
 		 295 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  51.27 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 		 268 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  54.02 
 
 		 290 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  52.8 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  53.52 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  51.97 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  50 
 
 		 280 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  52.63 
 
 		 269 aa  269  5e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  51.41 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  50.4 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  49.4 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  48.44 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  48.59 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  52.14 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  48.22 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  55.61 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  50 
 
 		 316 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  46.4 
 
 		 447 aa  244  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  48.37 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.02 
 
 		 278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  49.79 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  50.91 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  47.97 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  45.85 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  47.58 
 
 		 370 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  47.13 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  45.24 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  45.78 
 
 		 290 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  46.89 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  45.34 
 
 		 284 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  42.37 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  47.11 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  40.68 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  44.4 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  43.72 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  43.45 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  40.14 
 
 		 328 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.39 
 
 		 297 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  45.89 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  42.75 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  43.13 
 
 		 292 aa  215  7e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  44.98 
 
 		 294 aa  214  9e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  41.39 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  42.59 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  46.58 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  41.85 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.86 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  45.78 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  42.06 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  42.97 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  37.23 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  43.32 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.23 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  44.3 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  43.1 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  43.53 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  41.7 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  41.7 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  41.7 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  45.45 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  39.39 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  40.07 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  41.7 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  41.13 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  44.55 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  40.93 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  41.83 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  42.67 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  40.96 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.67 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.63 
 
 		 289 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.97 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  39.92 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>