More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2716 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  697    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  72.9 
 
 
328 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  70.61 
 
 
308 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  58.42 
 
 
299 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  52.04 
 
 
299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  51.75 
 
 
286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.41 
 
 
289 aa  319  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  51.89 
 
 
304 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  50.53 
 
 
290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  50.88 
 
 
290 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  55.64 
 
 
292 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  51.22 
 
 
294 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  52.26 
 
 
308 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  53 
 
 
300 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  50 
 
 
297 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  48.42 
 
 
293 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  51.53 
 
 
296 aa  292  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  53.66 
 
 
294 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  48.97 
 
 
295 aa  290  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  48.57 
 
 
290 aa  288  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  55.28 
 
 
294 aa  288  8e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  50.17 
 
 
296 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  52.16 
 
 
303 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  47.3 
 
 
304 aa  281  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  50.97 
 
 
292 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  49.61 
 
 
289 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  48.6 
 
 
289 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  50.74 
 
 
289 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.9 
 
 
305 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  44.17 
 
 
289 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  46.4 
 
 
293 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  46.1 
 
 
328 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  46.4 
 
 
330 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.37 
 
 
297 aa  255  8e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  46.24 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  46.1 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.67 
 
 
292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.15 
 
 
278 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  42.71 
 
 
292 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  46.27 
 
 
316 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  46.46 
 
 
318 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  41.78 
 
 
292 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  44.12 
 
 
294 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  44.44 
 
 
282 aa  239  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  43.22 
 
 
290 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  40.68 
 
 
447 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.86 
 
 
280 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  45.3 
 
 
282 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  44.58 
 
 
268 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  45.53 
 
 
286 aa  222  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  42.53 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  41 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  37.76 
 
 
357 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  43.53 
 
 
288 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  39.66 
 
 
288 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  39.66 
 
 
288 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  37.59 
 
 
275 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  39.66 
 
 
288 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  41.06 
 
 
269 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  43.4 
 
 
281 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  42.67 
 
 
291 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  40.82 
 
 
284 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  37.23 
 
 
275 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  38.15 
 
 
275 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  40.07 
 
 
317 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  41.22 
 
 
370 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  40.21 
 
 
278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  40.77 
 
 
281 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  41.15 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  37.5 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  38.33 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  39.84 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  47.6 
 
 
307 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  39.46 
 
 
279 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  42.49 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  39.68 
 
 
303 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  40.85 
 
 
279 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  40 
 
 
279 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  38.85 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  35.77 
 
 
357 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  41.92 
 
 
305 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  41.92 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  40.77 
 
 
279 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  40.17 
 
 
314 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  40.17 
 
 
303 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  39.66 
 
 
279 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  40.08 
 
 
305 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.78 
 
 
269 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  39.24 
 
 
279 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  39.24 
 
 
279 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  39.39 
 
 
295 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  38.21 
 
 
290 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.18 
 
 
276 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>