More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4394 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  86.69 
 
 
279 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  76.62 
 
 
278 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  73.74 
 
 
279 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  73.74 
 
 
279 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  72.66 
 
 
279 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  73.38 
 
 
279 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  72.3 
 
 
279 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  72.3 
 
 
279 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  72.3 
 
 
279 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  70.14 
 
 
279 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  70.5 
 
 
279 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  68.71 
 
 
279 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  55.09 
 
 
275 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  55.15 
 
 
275 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  54.72 
 
 
275 aa  315  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.51 
 
 
269 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  51.4 
 
 
305 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 
305 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  54.09 
 
 
268 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.75 
 
 
269 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.59 
 
 
276 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  51.89 
 
 
303 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  53.33 
 
 
295 aa  284  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  50 
 
 
290 aa  275  6e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  52.8 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.58 
 
 
280 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  49.41 
 
 
297 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  49.61 
 
 
268 aa  259  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  46.74 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  49.41 
 
 
348 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  48.43 
 
 
334 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  47.49 
 
 
316 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  47.66 
 
 
328 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  47.1 
 
 
318 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  46.12 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  49.79 
 
 
283 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  52.28 
 
 
307 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  44.08 
 
 
447 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  45.82 
 
 
290 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  43.96 
 
 
282 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  45.56 
 
 
284 aa  223  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  49.15 
 
 
330 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  49.57 
 
 
281 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  45.71 
 
 
284 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  44.22 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  47.15 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  47.18 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  45 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.2 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  45.2 
 
 
357 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  43.87 
 
 
281 aa  211  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  47.77 
 
 
370 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  40.7 
 
 
289 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  43.56 
 
 
304 aa  202  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.55 
 
 
284 aa  201  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  39.31 
 
 
299 aa  198  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  43.28 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  41.35 
 
 
357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  42.5 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  43.2 
 
 
347 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  38.91 
 
 
286 aa  193  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  40.62 
 
 
292 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.4 
 
 
305 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  40.96 
 
 
303 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  38.52 
 
 
289 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  39.62 
 
 
290 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  41.04 
 
 
300 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  37 
 
 
297 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  37.41 
 
 
328 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  39.62 
 
 
290 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  40.16 
 
 
291 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  40.93 
 
 
317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  39.58 
 
 
290 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.3 
 
 
308 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  39.92 
 
 
289 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  38.46 
 
 
293 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  40.51 
 
 
248 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  39.91 
 
 
294 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  38.11 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  37.82 
 
 
294 aa  182  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  36.46 
 
 
294 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  37.4 
 
 
294 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  37.16 
 
 
295 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  38.43 
 
 
292 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  36.24 
 
 
288 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  36.24 
 
 
288 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  36.24 
 
 
288 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  38.06 
 
 
292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.73 
 
 
289 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.12 
 
 
299 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  35.38 
 
 
338 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  35.51 
 
 
297 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  41.46 
 
 
303 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  38.33 
 
 
296 aa  175  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>