More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2529 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  57.87 
 
 		 280 aa  291  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  56.52 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  51.88 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  53.76 
 
 		 334 aa  277  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  53.44 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  53.26 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  53.38 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  52.31 
 
 		 279 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  51.5 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  51.5 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  51.13 
 
 		 279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  52.12 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  51.65 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  54.32 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  49.62 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  50.38 
 
 		 279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  52.63 
 
 		 275 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  50.38 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  52.26 
 
 		 328 aa  268  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  49.25 
 
 		 279 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  51.71 
 
 		 266 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.57 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  51.98 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  52.61 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  51.81 
 
 		 305 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  51.81 
 
 		 305 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.75 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.44 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0213  hypothetical protein  50.39 
 
 		 290 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  51.53 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  49.81 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  48.83 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  48.81 
 
 		 447 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0190  hypothetical protein  54.08 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  51 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  50.76 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1703  hypothetical protein  51.44 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  48.15 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4394  hypothetical protein  46.74 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  45.15 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  50.79 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  46.67 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  45.39 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  50.62 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  45.02 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  49.59 
 
 		 282 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  49.24 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  47.6 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  48.06 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  48.63 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  42.22 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  44.91 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.72 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  50.22 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  44.94 
 
 		 303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  48.32 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  42.8 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  42.07 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  42.96 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.64 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  41.6 
 
 		 286 aa  217  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  44.74 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  48.71 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  42.59 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  44.92 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  47.11 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  45.35 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  43.35 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  46.55 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  41.89 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  44.32 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0840  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  52.11 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  46.47 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  46.12 
 
 		 289 aa  211  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  40.67 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  41.74 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  41.94 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.74 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  42.91 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  46.9 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  44.91 
 
 		 300 aa  208  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  41.06 
 
 		 338 aa  208  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  49.36 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  45.67 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  42.62 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  47.27 
 
 		 347 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  43.56 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  43.73 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  47.7 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  43.02 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  49.77 
 
 		 370 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  43.02 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  43.02 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  46.01 
 
 		 357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>