More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1092 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1092  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 
299 aa  618  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2716  hypothetical protein  58.42 
 
 
338 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5397  hypothetical protein  61.28 
 
 
304 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0927  protein of unknown function DUF344  60.21 
 
 
299 aa  358  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3133  polyphosphate:AMP phosphotransferase  60.84 
 
 
289 aa  354  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.495283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3238  hypothetical protein  56.55 
 
 
328 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.556916  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6064  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.75 
 
 
308 aa  348  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0157035  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1928  protein of unknown function DUF344  55.79 
 
 
286 aa  330  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.450488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1190  protein of unknown function DUF344  55.59 
 
 
297 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0883712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0905  protein of unknown function DUF344  56.69 
 
 
296 aa  328  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0126  protein of unknown function DUF344  53.85 
 
 
290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0210  hypothetical protein  58.23 
 
 
292 aa  315  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0778377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1158  protein of unknown function DUF344  56.29 
 
 
296 aa  315  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4046  hypothetical protein  53.26 
 
 
295 aa  315  8e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1125  hypothetical protein  56.45 
 
 
289 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0107  protein of unknown function DUF344  56.86 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00556579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1024  hypothetical protein  56.63 
 
 
289 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1184  hypothetical protein  50.17 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0996  protein of unknown function DUF344  58 
 
 
294 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5049  protein of unknown function DUF344  52.96 
 
 
289 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0478  protein of unknown function DUF344  52.48 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.373856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2897  protein of unknown function DUF344  51.67 
 
 
300 aa  305  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0339082  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0794  protein of unknown function DUF344  55.47 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0355  hypothetical protein  56.5 
 
 
290 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0109  hypothetical protein  47.37 
 
 
304 aa  291  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1276  hypothetical protein  50.72 
 
 
292 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.991206  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1916  protein of unknown function DUF344  49.65 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.390967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2224  hypothetical protein  55.33 
 
 
294 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0107  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.03 
 
 
305 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500802  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0015  polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.01 
 
 
292 aa  276  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0575  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.42 
 
 
278 aa  275  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.32209  normal  0.307109 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4378  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  53.33 
 
 
297 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5338  protein of unknown function DUF344  48.39 
 
 
293 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.447578  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12140  hypothetical protein  51.02 
 
 
289 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1635  hypothetical protein  46.95 
 
 
282 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5339  protein of unknown function DUF344  44.48 
 
 
294 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2488  Polyphosphate:AMP phosphotransferase  44.2 
 
 
280 aa  246  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.838726  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5330  hypothetical protein  45.9 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109396  normal  0.080655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2256  hypothetical protein  45.77 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5853  protein of unknown function DUF344  45.42 
 
 
316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0870408  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4658  protein of unknown function DUF344  47.92 
 
 
334 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  0.299006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4808  protein of unknown function DUF344  47.55 
 
 
328 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198053  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1012  protein of unknown function DUF344  44.56 
 
 
282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2626  protein of unknown function DUF344  45.59 
 
 
268 aa  242  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  45.49 
 
 
447 aa  241  9e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4290  hypothetical protein  47.17 
 
 
348 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5527  hypothetical protein  45.66 
 
 
330 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912396  normal  0.0122134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0104  hypothetical protein  44.96 
 
 
288 aa  236  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0519106  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15560  hypothetical protein  43.93 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0115586  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0769  protein of unknown function DUF344  45.96 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0804  hypothetical protein  43.68 
 
 
291 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0639  hypothetical protein  47.95 
 
 
288 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0652  hypothetical protein  47.95 
 
 
288 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0632  hypothetical protein  47.54 
 
 
288 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2552  protein of unknown function DUF344  44.04 
 
 
284 aa  225  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000187286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3661  protein of unknown function DUF344  44.98 
 
 
284 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2247  hypothetical protein  43.98 
 
 
266 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.751059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1082  protein of unknown function DUF344  42.65 
 
 
317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0239  protein of unknown function DUF344  42.44 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.272592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5030  hypothetical protein  41.31 
 
 
292 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.848636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12063  hypothetical protein  42.74 
 
 
292 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.435169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2837  hypothetical protein  43.11 
 
 
284 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0350463  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2529  hypothetical protein  47.11 
 
 
269 aa  215  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2748  protein of unknown function DUF344  42.75 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0446574  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22180  hypothetical protein  42.28 
 
 
370 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7387  protein of unknown function DUF344  42.91 
 
 
281 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0138  hypothetical protein  41.99 
 
 
275 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2345  hypothetical protein  46.32 
 
 
283 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0039  hypothetical protein  38.05 
 
 
357 aa  208  9e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.290555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3539  protein of unknown function DUF344  41.28 
 
 
307 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000476466  decreased coverage  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0034  protein of unknown function DUF344  42.05 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16350  hypothetical protein  44.76 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0040  protein of unknown function DUF344  41.67 
 
 
275 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1882  protein of unknown function DUF344  43.78 
 
 
303 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.849579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3044  hypothetical protein  38.58 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0330  protein of unknown function DUF344  40.15 
 
 
279 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3103  hypothetical protein  38.78 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3161  hypothetical protein  38.2 
 
 
279 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.499425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0197  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.47 
 
 
269 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3014  protein of unknown function DUF344  39.19 
 
 
268 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0166  hypothetical protein  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2378  polyphosphate kinase  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6457  hypothetical protein  37.83 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0174  polyphosphate kinase  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0185  polyphosphate kinase  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2298  hypothetical protein  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.733259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2781  hypothetical protein  37.74 
 
 
279 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0056  hypothetical protein  40.07 
 
 
278 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0370  hypothetical protein  37.36 
 
 
279 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3289  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.6 
 
 
276 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3517  hypothetical protein  39.18 
 
 
303 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0765266  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0150  hypothetical protein  37.18 
 
 
279 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3122  hypothetical protein  37.08 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0387  protein of unknown function DUF344  38.62 
 
 
248 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.269315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0152  polyphosphate:AMP phosphotransferase  38.95 
 
 
269 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2492  hypothetical protein  36.7 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3106  hypothetical protein  36.7 
 
 
279 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0154  protein of unknown function DUF344  37.59 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4050  hypothetical protein  39.67 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0136  hypothetical protein  37.64 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>