173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1750 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1750  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0163231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  32.18 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  32.76 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  32.37 
 
 		 315 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  32.18 
 
 		 315 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  30.3 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3631  DNA polymerase III subunit epsilon  31.61 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.095912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  31.61 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 960 aa  67.8  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 944 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  32.12 
 
 		 1527 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  32.72 
 
 		 1449 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.65 
 
 		 1442 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  29.48 
 
 		 1407 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  32.1 
 
 		 1449 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  27.96 
 
 		 584 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.07 
 
 		 1421 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1341  DNA polymerase III subunit epsilon  29.94 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.9 
 
 		 927 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1068  DNA polymerase III, epsilon chain  30.54 
 
 		 277 aa  62  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0549  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.07 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.860226  hitchhiker  0.000115657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2247  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.93 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000477719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.55 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.32 
 
 		 956 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1633  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.44 
 
 		 721 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  31.74 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  29.7 
 
 		 1397 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.03 
 
 		 934 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.67 
 
 		 1433 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.58 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.61 
 
 		 930 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.77 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  25.86 
 
 		 578 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4120  DNA-directed DNA polymerase  31.54 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242284  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 609 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  28.38 
 
 		 551 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4300  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.5 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0011109  normal  0.487257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  27.43 
 
 		 570 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.38 
 
 		 595 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2482  DNA-directed DNA polymerase  27.33 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  28.42 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.76 
 
 		 565 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0863  DNA polymerase III subunit epsilon  29.34 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.54 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.05 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0726  DNA polymerase III subunit epsilon  29.3 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  29.84 
 
 		 1468 aa  52.4  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4781  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.05 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4665  exonuclease, putative  28.57 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.356009  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.25 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  31.06 
 
 		 1426 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  28.32 
 
 		 1390 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.18 
 
 		 605 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.41 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1885  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.14 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491413  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2613  DNA polymerase III subunit  26.75 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  32.76 
 
 		 1432 aa  51.2  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  34.48 
 
 		 1438 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  34.48 
 
 		 1438 aa  51.2  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  32.74 
 
 		 1635 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  32.18 
 
 		 1464 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  34.48 
 
 		 1436 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 476 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0009  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  27.12 
 
 		 1388 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.48 
 
 		 595 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.58 
 
 		 952 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1871  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.39 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235733  hitchhiker  0.000714256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  34.48 
 
 		 1362 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  30.34 
 
 		 1433 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1027  DNA polymerase III subunit epsilon  23.49 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.512461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.14 
 
 		 584 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0477  DNA polymerase III subunit epsilon  32.94 
 
 		 253 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.387234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.7 
 
 		 631 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  29.89 
 
 		 970 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  30.23 
 
 		 560 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  29.21 
 
 		 1433 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  27.95 
 
 		 585 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  27.62 
 
 		 281 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.29 
 
 		 978 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4924  exonuclease  27.5 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0768  DNA polymerase III subunit epsilon  24.69 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  25.81 
 
 		 578 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.38 
 
 		 300 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  26.77 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  31.33 
 
 		 1402 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>