More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2229 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2229  HhH-GPD  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  36.54 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  35.08 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1376  HhH-GPD family protein  32.84 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  37.56 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  30.33 
 
 		 363 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  34.87 
 
 		 352 aa  91.7  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.12 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  29.52 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 341 aa  89.4  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  32.29 
 
 		 396 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  33.88 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  30.61 
 
 		 353 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  33.84 
 
 		 383 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  28.99 
 
 		 360 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  28.57 
 
 		 352 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.59 
 
 		 367 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  28.57 
 
 		 352 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  27.6 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1951  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.04 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  28.27 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  30.67 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.49 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  31.1 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  28.32 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  30.05 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  34.05 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2013  A/G-specific adenine glycosylase  32.98 
 
 		 401 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  29.84 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  28.43 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1928  A/G-specific adenine glycosylase  32.98 
 
 		 399 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  29.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  29.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  36.08 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  30.05 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  29.36 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  26.98 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.81 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  29.67 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0401  A/G-specific adenine glycosylase protein  31.31 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  29.67 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  30.52 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1054  A/G-specific adenine glycosylase  30.61 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  29.81 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  30.53 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.79 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  32.3 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.61 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  32.64 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  32.64 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  31.28 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  28.65 
 
 		 353 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.26 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  28.93 
 
 		 354 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  28.17 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0448  HhH-GPD family protein  29.65 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.514494 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0431  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0511524  normal  0.0166148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.13 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  29.9 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  25.24 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  33.82 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2645  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.9 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  29.33 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  28.91 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  30.88 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1654  A/G-specific adenine glycosylase  31.16 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  27.18 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  28.19 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  28.57 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0256  A/G-specific adenine glycosylase  29.29 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1851  A/G-specific adenine glycosylase  30.05 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.641505  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  29.9 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  27.45 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  31.63 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  27.03 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  31.63 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  31.63 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1337  HhH-GPD family protein  33.18 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  32.97 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0443  A/G-specific adenine glycosylase  32.65 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  29.53 
 
 		 350 aa  75.5  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  31.94 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  27.75 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0283  A/G-specific adenine glycosylase  29.29 
 
 		 382 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1502  HhH-GPD family protein  32.77 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  28.35 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  30.05 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  33.5 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  30.41 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  28.57 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  27.08 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  33.6 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.8 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>