More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0448 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0448  HhH-GPD family protein  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.514494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  38.12 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  35.64 
 
 
341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  36.45 
 
 
355 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  34.31 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  35.68 
 
 
293 aa  125  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
407 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  34.93 
 
 
358 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.34 
 
 
386 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  31.13 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  33.03 
 
 
358 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  32.37 
 
 
370 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  33.49 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  35.27 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  33.66 
 
 
291 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  30.43 
 
 
381 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  31.94 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  30.09 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.71 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  32.08 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  33 
 
 
330 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  32.08 
 
 
352 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  32.3 
 
 
339 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1376  HhH-GPD family protein  30.96 
 
 
223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.28 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  33.01 
 
 
383 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.37 
 
 
360 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  28.31 
 
 
386 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  31.16 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  31.48 
 
 
368 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  32.61 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  33.67 
 
 
347 aa  111  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  31.84 
 
 
360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0414  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  32.02 
 
 
339 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  32.02 
 
 
339 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  32.18 
 
 
351 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00282  A/G-specific adenine glycosylase  28.57 
 
 
355 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.274494  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.27 
 
 
344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  29.57 
 
 
369 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  30.84 
 
 
355 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  32.35 
 
 
291 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.38 
 
 
357 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  30.73 
 
 
345 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  30.73 
 
 
345 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  30.73 
 
 
353 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  32.38 
 
 
357 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.52 
 
 
355 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  30.37 
 
 
355 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.78 
 
 
363 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3015  A/G-specific adenine glycosylase  32.57 
 
 
369 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4436  HhH-GPD family protein  33.51 
 
 
335 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.907069  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2623  A/G-specific adenine glycosylase  32.57 
 
 
369 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202098  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  29.44 
 
 
353 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.73 
 
 
375 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  32.16 
 
 
317 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  33.17 
 
 
359 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  33.63 
 
 
335 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  29.91 
 
 
355 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  30.88 
 
 
353 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  28.57 
 
 
373 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  32 
 
 
351 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0701  A/G-specific adenine glycosylase  32.35 
 
 
615 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0292905  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  30.37 
 
 
355 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.52 
 
 
355 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  32.37 
 
 
313 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  31.55 
 
 
384 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  29.72 
 
 
354 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  31.92 
 
 
304 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.76 
 
 
355 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  33.17 
 
 
354 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  31.11 
 
 
318 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  29.44 
 
 
363 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  31.96 
 
 
382 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  30.62 
 
 
303 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  32.02 
 
 
371 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  29.3 
 
 
384 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>