More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0431 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0431  HhH-GPD family protein  100 
 
 
225 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0511524  normal  0.0166148 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1001  HhH-GPD family protein  39.09 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.811853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0448  HhH-GPD family protein  32.66 
 
 
262 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.514494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  34.87 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  29.25 
 
 
350 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  33.02 
 
 
357 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.02 
 
 
357 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  32.32 
 
 
365 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  36.73 
 
 
383 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  32.67 
 
 
361 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  32.32 
 
 
365 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
353 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5680  HhH-GPD family protein  36.14 
 
 
230 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  32.34 
 
 
381 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  29.25 
 
 
362 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  31.31 
 
 
364 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  29.27 
 
 
347 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  29.77 
 
 
382 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1376  HhH-GPD family protein  31.8 
 
 
223 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  31.78 
 
 
384 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  31.82 
 
 
365 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3492  A/G-specific adenine glycosylase  34 
 
 
384 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000130303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  32.18 
 
 
368 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 
311 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  30.69 
 
 
352 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  29.76 
 
 
368 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1108  A/G-specific adenine glycosylase  27.49 
 
 
354 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000562379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  30.39 
 
 
341 aa  101  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  29.06 
 
 
365 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  31.73 
 
 
363 aa  100  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  30.73 
 
 
350 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3407  adenine DNA glycosylase  31.68 
 
 
368 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0148197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  32.26 
 
 
212 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  30.43 
 
 
350 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  27.49 
 
 
354 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  30.39 
 
 
419 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  30.2 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
363 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  30.2 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  30.2 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  30.2 
 
 
350 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1141  A/G-specific adenine glycosylase  34.62 
 
 
358 aa  99.4  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  33.33 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.49 
 
 
361 aa  99.4  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  29.81 
 
 
350 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  32.7 
 
 
356 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  34.45 
 
 
293 aa  99  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  30.77 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  32.69 
 
 
303 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  34.43 
 
 
299 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  32.12 
 
 
366 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  29.81 
 
 
360 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  29.35 
 
 
345 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  35.89 
 
 
291 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  29.35 
 
 
345 aa  98.6  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  30.41 
 
 
331 aa  98.6  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  29.81 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  29.81 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  29.81 
 
 
360 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  28.92 
 
 
353 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  29.81 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  29.81 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  29.7 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  28.78 
 
 
351 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  30.2 
 
 
350 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.77 
 
 
357 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  29.33 
 
 
360 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  35.45 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  30.39 
 
 
381 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  29.21 
 
 
388 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.33 
 
 
363 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  34.95 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  30.88 
 
 
355 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.05 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  36 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  29.9 
 
 
372 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  31.37 
 
 
355 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.5 
 
 
353 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  29.9 
 
 
371 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  36.22 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  29.69 
 
 
357 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  36.22 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  30.39 
 
 
355 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  28 
 
 
368 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  32.68 
 
 
362 aa  96.3  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.06 
 
 
372 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  33.7 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  38.1 
 
 
291 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  29.06 
 
 
368 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.88 
 
 
355 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  26.85 
 
 
354 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  30.41 
 
 
355 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>