269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3609 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  100 
 
 
185 aa  350  7e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  41.28 
 
 
198 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  36.09 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.04 
 
 
198 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  41.71 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  40.35 
 
 
196 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  41.1 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  41.1 
 
 
192 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  41.95 
 
 
204 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  39.88 
 
 
202 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.13 
 
 
189 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  41.18 
 
 
185 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  39.68 
 
 
189 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  39.16 
 
 
193 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  42.29 
 
 
196 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  40.88 
 
 
204 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  40.94 
 
 
187 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  42.94 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  41.42 
 
 
199 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  41.98 
 
 
212 aa  98.2  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  41.86 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.83 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.83 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  41.36 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.83 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.83 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.83 
 
 
199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.79 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  40.12 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  36.63 
 
 
196 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42.33 
 
 
226 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  42.33 
 
 
226 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  42.33 
 
 
226 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  41.52 
 
 
202 aa  94.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  40.12 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  42.11 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  39.26 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  37.28 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  37.42 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  38.17 
 
 
361 aa  87.8  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  38.04 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  41.42 
 
 
233 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  38.22 
 
 
190 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  30.06 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  38.51 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.93 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  40.46 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  40.59 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.97 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  29.31 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  39.69 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.59 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  36.07 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37.35 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  26.71 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.83 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.37 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  31.49 
 
 
390 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  33.54 
 
 
418 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  30.23 
 
 
383 aa  61.6  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.18 
 
 
418 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  34.18 
 
 
382 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  33.54 
 
 
418 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  26.26 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.59 
 
 
383 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  32.58 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.14 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.11 
 
 
420 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  38.26 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  30.3 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  33.77 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  32.57 
 
 
383 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  35.76 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  33.77 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  33.77 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  22.22 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  31.41 
 
 
390 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  25.93 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  36.36 
 
 
207 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  22.22 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  37.39 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  37.39 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  34.71 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  37.39 
 
 
175 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  35.03 
 
 
203 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  23.81 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  32.2 
 
 
172 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  39.34 
 
 
450 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.11 
 
 
391 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  34.45 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  32.03 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  31.09 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.86 
 
 
416 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  30.77 
 
 
390 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  30.77 
 
 
390 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  36.13 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  25.18 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28.39 
 
 
383 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  34.26 
 
 
358 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  34.45 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>