More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4022 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  69.35 
 
 
196 aa  250  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  68.91 
 
 
202 aa  246  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  66.83 
 
 
202 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  64.62 
 
 
198 aa  240  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  58.03 
 
 
196 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  61.5 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  60.96 
 
 
199 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  58.67 
 
 
201 aa  195  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  55.56 
 
 
209 aa  194  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  55.08 
 
 
196 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  54.65 
 
 
233 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  38.97 
 
 
192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  40 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.23 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  35.63 
 
 
178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  39.77 
 
 
185 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  38.74 
 
 
193 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  36.52 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  39.88 
 
 
193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  38.41 
 
 
198 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  38.55 
 
 
189 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  39.34 
 
 
199 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  36.78 
 
 
202 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  42.24 
 
 
199 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  36.02 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  42.24 
 
 
199 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.99 
 
 
199 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  37.1 
 
 
204 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  42.24 
 
 
185 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.99 
 
 
199 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.99 
 
 
199 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  34.95 
 
 
190 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  37.79 
 
 
185 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  33.33 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  32.63 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  37.35 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  35.14 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  42.34 
 
 
361 aa  91.3  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  39.26 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.61 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  38.04 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  34.5 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  35.44 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  37.36 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.05 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  38 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  35.47 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  38 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  35.47 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  38 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.18 
 
 
382 aa  82.4  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.93 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  34.67 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  36 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  32.34 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.05 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  35.56 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  27.78 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.57 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.57 
 
 
390 aa  72  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  29.95 
 
 
390 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  29.95 
 
 
390 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.36 
 
 
392 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.22 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  33.85 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.15 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  29.41 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  26.55 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.87 
 
 
396 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.26 
 
 
397 aa  67.8  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  30.46 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.87 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.87 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.87 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  30.06 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  30.06 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  32.89 
 
 
393 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  28.79 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  26.01 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.14 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  26.01 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  31.32 
 
 
431 aa  66.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.57 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.21 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.78 
 
 
393 aa  65.5  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.95 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  29.21 
 
 
456 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  24.4 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.41 
 
 
392 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.51 
 
 
383 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.67 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.76 
 
 
392 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.62 
 
 
390 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  26.37 
 
 
188 aa  63.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  30.17 
 
 
379 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  27.78 
 
 
428 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.28 
 
 
449 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  33.61 
 
 
378 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>