More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2509 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  100 
 
 		 183 aa  360  9e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  97.81 
 
 		 183 aa  352  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  52.3 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  47.22 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  41.21 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  38.46 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  35.71 
 
 		 179 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  34.95 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  42.69 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  37.5 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  35.98 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  34.5 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  33.11 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  33.92 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  36.41 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  34.81 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  32.35 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  36.23 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  33.33 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  34.41 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  36.99 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.55 
 
 		 387 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.94 
 
 		 387 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.86 
 
 		 393 aa  90.9  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  32.77 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  35.62 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  31.18 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.17 
 
 		 404 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  28.57 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  29.41 
 
 		 167 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  33.33 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  33.33 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.74 
 
 		 376 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 		 386 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  31.58 
 
 		 188 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.26 
 
 		 154 aa  84.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.31 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  40.58 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  33.13 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  28.46 
 
 		 418 aa  82  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  28.74 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  33.33 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.14 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  31.5 
 
 		 446 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.49 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.88 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.54 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  29.24 
 
 		 389 aa  78.6  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  28.57 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  28.57 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.45 
 
 		 379 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.24 
 
 		 428 aa  77.8  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  28.21 
 
 		 382 aa  77.4  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.57 
 
 		 396 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.57 
 
 		 396 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.57 
 
 		 396 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.15 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  27.12 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  36.13 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.76 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.75 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.98 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.34 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  30 
 
 		 444 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  33.53 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.86 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28.38 
 
 		 383 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  31.52 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  31.52 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  28.46 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  26.67 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  32.48 
 
 		 453 aa  74.7  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.64 
 
 		 416 aa  74.7  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.36 
 
 		 415 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  26.53 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  30.95 
 
 		 453 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  30.37 
 
 		 378 aa  74.3  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  33.59 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  29.48 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  26.74 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.49 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.97 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  32.82 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  26.74 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.97 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  28.83 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.9 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  31.93 
 
 		 450 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  28.26 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  30.6 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  36.79 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  36.79 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  30.68 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.05 
 
 		 401 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.11 
 
 		 348 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  30.71 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>