More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2518 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  100 
 
 		 193 aa  370  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  76.37 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  64.94 
 
 		 192 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  64.37 
 
 		 192 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  63.22 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  46.02 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  44.13 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  44.02 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  43.3 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  44.32 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  41.28 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  45.26 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  39.08 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  42.56 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  42.86 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  40 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  43.09 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  42.56 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  43.82 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  45.98 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  40.98 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  45.98 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  45.98 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  41.15 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  45.4 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  45.4 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  45.4 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  44.33 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  43.04 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  43.86 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  41.05 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  44.38 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  44.38 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  44.58 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  43.24 
 
 		 215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  39.52 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  42.69 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  38.46 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  48.28 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  39.6 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.51 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42.53 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  42.29 
 
 		 361 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  43.2 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  43.2 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.87 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  41.45 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.47 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.47 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.47 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  37.43 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.79 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  35.16 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  34.17 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.88 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  28.24 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.61 
 
 		 415 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.11 
 
 		 416 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.52 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  33.59 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  27.1 
 
 		 154 aa  74.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  33.85 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.92 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  42.39 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  34.27 
 
 		 450 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.24 
 
 		 443 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.54 
 
 		 400 aa  71.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  29.5 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  33.33 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  31.61 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.1 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  41.49 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  32.62 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  31.88 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  28.1 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.67 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.25 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  32.62 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  32.62 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  40.22 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.59 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  32.62 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.86 
 
 		 407 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.99 
 
 		 465 aa  68.2  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.6 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  31.78 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  38.89 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  31.91 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.67 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  30.53 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  31.91 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.45 
 
 		 404 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  41.49 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  31.58 
 
 		 380 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  42.5 
 
 		 403 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  30.91 
 
 		 379 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.59 
 
 		 390 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  33.33 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  32.56 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  31.82 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>