More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1607 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  100 
 
 
188 aa  364  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  52.94 
 
 
203 aa  200  9e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  37.16 
 
 
182 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  37.02 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  35.86 
 
 
179 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  33.89 
 
 
184 aa  97.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  31.07 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  31.07 
 
 
193 aa  94.7  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  33.14 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  33.86 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  34.43 
 
 
176 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  33.71 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  32.97 
 
 
187 aa  85.1  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  41.41 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.46 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  33.92 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.58 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.14 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  33.61 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  26.86 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  26.63 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  30.22 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  32.03 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  29.07 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  34.38 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  32.81 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  33.06 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  31.45 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.73 
 
 
376 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  27.17 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  31.07 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  31.25 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  24.86 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1208  Chromate transporter  26.35 
 
 
402 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567359  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  28.16 
 
 
379 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  39.02 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.13 
 
 
379 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.3 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.09 
 
 
404 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.1 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.09 
 
 
393 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  26.51 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  25.33 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.33 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  28.26 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.71 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  24.59 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  25.33 
 
 
418 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  24.28 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.48 
 
 
386 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  27.22 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  28.93 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 
382 aa  64.7  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  28.93 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25 
 
 
387 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  27.56 
 
 
376 aa  64.3  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  24.73 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.92 
 
 
393 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.41 
 
 
387 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.16 
 
 
420 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  23.49 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.09 
 
 
391 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  26.49 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  35.11 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3336  chromate transporter  29.7 
 
 
402 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1287  chromate transporter  33.81 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  29.17 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  26.06 
 
 
382 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.27 
 
 
397 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  29.84 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  25.27 
 
 
202 aa  62  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  29.84 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  28.26 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2121  chromate transporter  26.62 
 
 
411 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0728447  normal  0.051785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  25.27 
 
 
202 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  25.34 
 
 
213 aa  61.6  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  24.72 
 
 
198 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  24.49 
 
 
390 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  25.41 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.29 
 
 
392 aa  61.2  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  23.81 
 
 
390 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  25 
 
 
383 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  26.25 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  32.53 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  26.16 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  28.77 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  29.69 
 
 
415 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.14 
 
 
441 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  25.77 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  25.62 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1914  chromate transporter  26.09 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.21 
 
 
167 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  28.93 
 
 
389 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  23.08 
 
 
383 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  25 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.68 
 
 
407 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3496  Chromate transporter  31.01 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.78 
 
 
483 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  27.65 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  25.41 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>