194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1914 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1914  chromate transporter  100 
 
 
180 aa  350  7e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  39.58 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  38.89 
 
 
171 aa  104  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  30.86 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  32.4 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  36.81 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  34.06 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.66 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  29.49 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  32.58 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  31.58 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.7 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  29.87 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  37.23 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  36.05 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  27.33 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  29.41 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  29.65 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  28.83 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  30 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  25.97 
 
 
190 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  28.46 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  29.23 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  28.78 
 
 
190 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.43 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  31.4 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  27.54 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  24.53 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.93 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  31.06 
 
 
213 aa  58.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  29.77 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  32.04 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  26.32 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  25.5 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  27.78 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  31.91 
 
 
430 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  32.53 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.69 
 
 
383 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  28.17 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  37.14 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  30.95 
 
 
381 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.08 
 
 
420 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1752  Chromate transporter  31.48 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  31.71 
 
 
390 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  25 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  28.57 
 
 
385 aa  52.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.91 
 
 
405 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  26.63 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  23.87 
 
 
493 aa  51.6  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  34.62 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  29.47 
 
 
383 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  34.62 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  30.49 
 
 
402 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  25.33 
 
 
393 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  29.27 
 
 
418 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  29.27 
 
 
418 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.27 
 
 
418 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  29.76 
 
 
383 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  30.49 
 
 
390 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  30.49 
 
 
390 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  27.47 
 
 
390 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  29.27 
 
 
382 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  30.08 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  27.86 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  30.49 
 
 
386 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.93 
 
 
395 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  31.52 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1753  Chromate transporter  30.14 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  28.57 
 
 
395 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  25.23 
 
 
401 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 
404 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  25 
 
 
403 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  25.44 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  25.44 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  25.41 
 
 
196 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0459  chromate transporter superfamily protein  30.43 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0242259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  25.9 
 
 
192 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  28.68 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  28.12 
 
 
188 aa  47.8  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  28.05 
 
 
383 aa  48.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  25.9 
 
 
192 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  25 
 
 
401 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  21.85 
 
 
408 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  25 
 
 
401 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  25 
 
 
401 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  24.82 
 
 
185 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.96 
 
 
352 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  24.84 
 
 
392 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  31.33 
 
 
387 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  33.33 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.26 
 
 
387 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  26.74 
 
 
401 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  33.8 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  22.78 
 
 
396 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.83 
 
 
203 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  31.31 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.78 
 
 
203 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.59 
 
 
416 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.78 
 
 
203 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>