More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2840 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  100 
 
 
180 aa  360  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  51.15 
 
 
184 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  52.94 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  49.14 
 
 
173 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  41.14 
 
 
213 aa  112  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  40.12 
 
 
172 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  35.59 
 
 
199 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  36.31 
 
 
176 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  36.42 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  36.81 
 
 
179 aa  99  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.93 
 
 
472 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  32.96 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  31.85 
 
 
154 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
386 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.05 
 
 
472 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  32.18 
 
 
171 aa  87.8  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  35.34 
 
 
393 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  33.53 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  35.4 
 
 
174 aa  85.5  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  38.17 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.93 
 
 
404 aa  84  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.09 
 
 
387 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  32.93 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  34.84 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.09 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.24 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  34.06 
 
 
451 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  28.19 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  27.65 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  34.51 
 
 
379 aa  82  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  30.67 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  28.57 
 
 
450 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  27.49 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  39.68 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  29.03 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  35.26 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.48 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.14 
 
 
447 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.49 
 
 
454 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  27.74 
 
 
450 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.36 
 
 
391 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.19 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  31.34 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  33.56 
 
 
382 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  35.03 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  32.5 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  30.67 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  37.01 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.82 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.73 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  32.52 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.32 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  33.56 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  33.56 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  31.28 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.54 
 
 
392 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  33.33 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.82 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.36 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.69 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.31 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.88 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  27.06 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.88 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  29.82 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.88 
 
 
396 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  38.05 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.88 
 
 
396 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  31.29 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  31.71 
 
 
431 aa  72.4  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  30.57 
 
 
444 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  32.84 
 
 
432 aa  71.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.09 
 
 
441 aa  71.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  31.71 
 
 
445 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.28 
 
 
385 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  25.88 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  28.66 
 
 
376 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  32.2 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  30.71 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.1 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  25.73 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  30.71 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  30.08 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0197  chromate transporter  41.79 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  50 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  29.77 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.3 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  31.82 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.97 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.6 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  26.51 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  34.15 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  31.43 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  32.48 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  30.71 
 
 
403 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.17 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.43 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  29.14 
 
 
425 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  35.56 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  32.72 
 
 
454 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>