More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4176 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  100 
 
 
177 aa  346  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  63.22 
 
 
175 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  43.71 
 
 
175 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  39.31 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  41.92 
 
 
175 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  40.34 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  40.34 
 
 
175 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  40.34 
 
 
175 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  40.85 
 
 
175 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  41.4 
 
 
176 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  41.21 
 
 
173 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  36.21 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  37.27 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  37.75 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  35.71 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  35.09 
 
 
179 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  43.37 
 
 
176 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  37.58 
 
 
176 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  34.91 
 
 
200 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  33.14 
 
 
178 aa  104  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  44.44 
 
 
176 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  48.31 
 
 
170 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  39.75 
 
 
172 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  35.81 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  35.81 
 
 
180 aa  97.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  39.18 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  38.58 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  37.8 
 
 
180 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  35.85 
 
 
174 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  36.02 
 
 
176 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  33.54 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  35.63 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  40.17 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  32.56 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  37.74 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  32.56 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.68 
 
 
174 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  33.54 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  37.27 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.93 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.13 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.29 
 
 
420 aa  79  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  31.07 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  34.88 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30.12 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  38.1 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.56 
 
 
387 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  35.29 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.78 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.76 
 
 
416 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  28.4 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  31.76 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  39.23 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  31.76 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.56 
 
 
392 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  31.76 
 
 
390 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.51 
 
 
392 aa  70.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.11 
 
 
397 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.02 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  30.82 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.36 
 
 
387 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.74 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  33.14 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  32.54 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  31.97 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.3 
 
 
392 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.71 
 
 
396 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.11 
 
 
396 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.11 
 
 
396 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.56 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.11 
 
 
396 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.46 
 
 
386 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  34.97 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  30.61 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  29.82 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.3 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35 
 
 
415 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  29.11 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  29.11 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  32.37 
 
 
382 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  34.68 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  31.46 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.19 
 
 
394 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.66 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  34.48 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0471  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.53 
 
 
430 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  29.38 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.82 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  43.44 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  32.06 
 
 
401 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0054  Chromate transporter  35.62 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  33.33 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  26.04 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  28.12 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0466  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.95 
 
 
444 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>