169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3610 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  100 
 
 		 175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  42.86 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  43.1 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  36.14 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  38.06 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  39.02 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  39.05 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  34.36 
 
 		 176 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.84 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  36.48 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  39.02 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  38.41 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  39.02 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  38.41 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  39.02 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  39.35 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  39.13 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  39.63 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  39.33 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  36.77 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  33.74 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  38.21 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  40.98 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  36.55 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  36.05 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  36.77 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  37.06 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  34.29 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  38.51 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  36.23 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  41.38 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  36.47 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  40.52 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  40.52 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  40.52 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  39.66 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  35.95 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  35.19 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  35.95 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  33.09 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  32.48 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  34.21 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  37.65 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  43.17 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  32.9 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  33.33 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  34.5 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.34 
 
 		 415 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  34.85 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  33.33 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  25.15 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  33.12 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  26.22 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.46 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  26.49 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  38.4 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.81 
 
 		 416 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  32.53 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  27.61 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  30.72 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  36.13 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  27.75 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  31.36 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  33.11 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  36 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.28 
 
 		 392 aa  54.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  32.5 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.08 
 
 		 392 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.32 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  30.89 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  30 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  33.11 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  25.84 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  31.87 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  31.34 
 
 		 389 aa  51.2  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  31.62 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  28.57 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40 
 
 		 382 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.87 
 
 		 396 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  40 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  38.82 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1741  chromate transporter  41.89 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  38.82 
 
 		 401 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.41 
 
 		 392 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  35.51 
 
 		 401 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.41 
 
 		 396 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  37.65 
 
 		 397 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  29.41 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  29.41 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.41 
 
 		 396 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.41 
 
 		 396 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  28.78 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.65 
 
 		 390 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.65 
 
 		 390 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.78 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>