More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2508 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  100 
 
 		 450 aa  890    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.01 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.3 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.01 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  31.32 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  35.29 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.76 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  33.72 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.19 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  26.88 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  29.14 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.28 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  36.78 
 
 		 183 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  27.79 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.93 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  33.18 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.99 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.23 
 
 		 386 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.54 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.34 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  37.93 
 
 		 153 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.61 
 
 		 383 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.5 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.44 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  28.15 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  29.13 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  27.19 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  27.74 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  28.88 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  34.23 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.5 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  28.29 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.57 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  35.71 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.79 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.05 
 
 		 450 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.93 
 
 		 456 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.35 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  27.25 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  28.29 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  32.35 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  29.61 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  25.47 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  27.96 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.58 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  32.27 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.98 
 
 		 392 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  27.71 
 
 		 456 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.06 
 
 		 376 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  26.68 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  30.96 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  26.68 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  26.68 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  27.96 
 
 		 444 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.83 
 
 		 390 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  25.75 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.52 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  31.42 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.46 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.99 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.86 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  30.58 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  26.35 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  28.21 
 
 		 346 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  35.28 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  26.3 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.77 
 
 		 389 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.04 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.02 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.87 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  27.34 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  27.18 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  27.47 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  26.33 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  29.72 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  29.13 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.91 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.12 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  26.6 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.09 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.79 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.42 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  31.41 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  29.77 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  31.41 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  31.41 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  24.46 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  27.93 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  26.55 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  30.66 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  26.39 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  25.93 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  28.17 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  30.12 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  24.42 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  27.59 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  30.73 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>