213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2260 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  99.5 
 
 
200 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  73.85 
 
 
194 aa  277  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  72.53 
 
 
202 aa  247  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  73.12 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  60.66 
 
 
194 aa  231  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  62.87 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  63.43 
 
 
198 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  56.99 
 
 
202 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  55.76 
 
 
199 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  40.64 
 
 
182 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  41.62 
 
 
181 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  40.86 
 
 
176 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  40.32 
 
 
176 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  47.31 
 
 
168 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  40.59 
 
 
176 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  37.64 
 
 
175 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  38.2 
 
 
175 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  38.2 
 
 
175 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  38.2 
 
 
175 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  37.64 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  37.64 
 
 
175 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  34.78 
 
 
177 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  36.31 
 
 
176 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  38.86 
 
 
174 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  35.75 
 
 
175 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  36.76 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  32.6 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  33.7 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.75 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  29.73 
 
 
180 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  33.7 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  32.93 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  32.92 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  31.25 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  33.15 
 
 
176 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  31.36 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  33.82 
 
 
175 aa  79  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  36.26 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  31.52 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  35.56 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  29.67 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.06 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.11 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  31.17 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.92 
 
 
393 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  29.94 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  29.94 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  30.54 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  32.99 
 
 
393 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  30.54 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  32.59 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  28.67 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  29.71 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.16 
 
 
416 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  30.08 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.11 
 
 
415 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.86 
 
 
387 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.97 
 
 
392 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  25.3 
 
 
408 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.97 
 
 
392 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  25.86 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  27.17 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.31 
 
 
387 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.91 
 
 
420 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.75 
 
 
395 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  26.24 
 
 
187 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  33.33 
 
 
383 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  27.93 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  28.57 
 
 
382 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.73 
 
 
392 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.46 
 
 
404 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  30.77 
 
 
398 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  28.32 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  33.79 
 
 
401 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  26.23 
 
 
446 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.94 
 
 
441 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  30 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  33.07 
 
 
170 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  22.5 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30 
 
 
154 aa  55.1  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  26.67 
 
 
450 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  23.31 
 
 
396 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.74 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  26.23 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  23.31 
 
 
396 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  28.73 
 
 
394 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  23.31 
 
 
396 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  31.79 
 
 
411 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  26.67 
 
 
450 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  23.2 
 
 
455 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  26.28 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  23.31 
 
 
396 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  24.31 
 
 
453 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.69 
 
 
390 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>