187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0833 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  100 
 
 		 176 aa  347  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  97.73 
 
 		 176 aa  342  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  81.14 
 
 		 181 aa  295  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  60 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  56.58 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  38.82 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  40.36 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  42.94 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  37.5 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  42.21 
 
 		 194 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  41.07 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  40 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  38.55 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  36.02 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  36.02 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  36.02 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  37.34 
 
 		 173 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  35.4 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  35.4 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  35.4 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  34.78 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  37.89 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  39.43 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  36.05 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  36.65 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  43.79 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  37.27 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  31.79 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  34.69 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  39.87 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  37.06 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  34.97 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  35.33 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  38.85 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  34.67 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  38.24 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  39.88 
 
 		 200 aa  95.5  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  39.88 
 
 		 200 aa  95.5  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  34.67 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  34 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  32.7 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  39.42 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  43.71 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  33.96 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  33.11 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  32.56 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  36.17 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  33.93 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  30.19 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  23.84 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  29.69 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.65 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  24.71 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  24.39 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.14 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  24.55 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  23.6 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  28.67 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  23.93 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  33.03 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  23.61 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  31.19 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  18.56 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  23.08 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  29.47 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  32.54 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  25.29 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  32.54 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  28.89 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  21.15 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.15 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  32.82 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  21.8 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.76 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  26.22 
 
 		 393 aa  54.3  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  19.53 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.85 
 
 		 472 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.77 
 
 		 404 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  27.37 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  29.45 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.15 
 
 		 387 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  29.75 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.71 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  29.27 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.85 
 
 		 382 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  21.34 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  35.48 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  35.48 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  35.48 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  31 
 
 		 404 aa  50.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  35.48 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  25.36 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  29.38 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  27.62 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>