More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0480 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  97.47 
 
 
176 aa  309  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  86.05 
 
 
175 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  85.47 
 
 
175 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  85.47 
 
 
175 aa  298  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  84.88 
 
 
175 aa  297  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  85.47 
 
 
175 aa  296  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  83.72 
 
 
175 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  84.88 
 
 
175 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  73.26 
 
 
176 aa  248  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  73.26 
 
 
176 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  72.78 
 
 
176 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  68.42 
 
 
173 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  63.74 
 
 
173 aa  221  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  41.14 
 
 
179 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  40.99 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  39.76 
 
 
200 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  36.84 
 
 
175 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  39.05 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  44.83 
 
 
170 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  38.6 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  35.23 
 
 
181 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  40.12 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  37.58 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  34.73 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  37.18 
 
 
180 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  36.02 
 
 
176 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  37.58 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  36.02 
 
 
176 aa  111  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  39.55 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  38.81 
 
 
180 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  36.09 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  36.05 
 
 
180 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  37.89 
 
 
177 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  34.38 
 
 
176 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  38.24 
 
 
194 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  34.62 
 
 
176 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  37.42 
 
 
194 aa  92.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  36.54 
 
 
175 aa  90.9  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  33.76 
 
 
202 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5108  Chromate transporter  32.3 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  38.13 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  33.93 
 
 
212 aa  84.3  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  35.26 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  32.91 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  31.58 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.91 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  34.12 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.59 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25 
 
 
420 aa  78.6  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  28.3 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  32.05 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  32.05 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  25.47 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0955  chromate transporter  31.79 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.457444  normal  0.869968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  26.19 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  30.57 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  25.93 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  26.95 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  27.88 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.91 
 
 
416 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.28 
 
 
472 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.04 
 
 
386 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  23.21 
 
 
172 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.82 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  26.95 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  27.27 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.69 
 
 
397 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  27.27 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  25.49 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.18 
 
 
472 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.29 
 
 
395 aa  65.5  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  24.84 
 
 
207 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  24.84 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  24.84 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.28 
 
 
394 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  29.45 
 
 
213 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  27.06 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0054  Chromate transporter  33.12 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  35.85 
 
 
409 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.93 
 
 
415 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  23.58 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  25.44 
 
 
376 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.66 
 
 
379 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  25.3 
 
 
382 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1310  chromate transport protein, putative  27.85 
 
 
397 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.15 
 
 
392 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2220  chromate transport protein, putative  27.85 
 
 
402 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1150  chromate transporter  27.85 
 
 
397 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.56 
 
 
390 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1159  chromate transporter  27.85 
 
 
397 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.725557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2539  chromate transporter  27.85 
 
 
397 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2075  chromate transporter  27.85 
 
 
397 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.231578  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5694  chromate transporter  29.66 
 
 
423 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  30.56 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>