More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0715 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  100 
 
 		 174 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  97.13 
 
 		 174 aa  305  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  68.39 
 
 		 174 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  63.79 
 
 		 174 aa  227  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  53.89 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  37.43 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  35.67 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  41.94 
 
 		 393 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.35 
 
 		 387 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.16 
 
 		 387 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.75 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  35.09 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  34.25 
 
 		 199 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  34.73 
 
 		 416 aa  98.2  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  37.7 
 
 		 420 aa  97.8  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.12 
 
 		 395 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.94 
 
 		 404 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.43 
 
 		 472 aa  93.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.33 
 
 		 390 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  30.64 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35 
 
 		 472 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  37.42 
 
 		 379 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  35.11 
 
 		 394 aa  91.7  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  43.61 
 
 		 383 aa  91.3  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  34.36 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.13 
 
 		 386 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.67 
 
 		 382 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  33.33 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.76 
 
 		 392 aa  88.2  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.24 
 
 		 397 aa  88.2  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  35.61 
 
 		 401 aa  88.2  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  32.56 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  33.33 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  32.75 
 
 		 408 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  32.12 
 
 		 393 aa  87  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.72 
 
 		 379 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  30.64 
 
 		 376 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.58 
 
 		 396 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.82 
 
 		 390 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  33.83 
 
 		 173 aa  85.1  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  32.12 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  32.12 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  30.07 
 
 		 390 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.06 
 
 		 390 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  30.07 
 
 		 390 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  30.07 
 
 		 390 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  42.15 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  30.73 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.39 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  28.92 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  28.31 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.34 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  31.9 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.39 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  28.92 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  28.92 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  40.16 
 
 		 428 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  30.99 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  33.14 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  27.98 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  30.99 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  28.31 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  31.85 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  29.82 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  28.31 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  34.03 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  31.3 
 
 		 398 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  30.41 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  27.71 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.57 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.95 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.92 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.19 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  31.94 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  35.09 
 
 		 382 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  38.32 
 
 		 430 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.45 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  31.9 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.03 
 
 		 418 aa  78.2  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  35.16 
 
 		 412 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  35.16 
 
 		 412 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  37.66 
 
 		 383 aa  77.8  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  33.93 
 
 		 409 aa  77.8  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  35.77 
 
 		 389 aa  77.4  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  33.93 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  33.14 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  33.93 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  32.89 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  36.9 
 
 		 394 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  31.11 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.9 
 
 		 395 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.41 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.77 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.3 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  31.55 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  36.43 
 
 		 443 aa  74.7  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  34.55 
 
 		 463 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  35.9 
 
 		 393 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  32.35 
 
 		 432 aa  74.7  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>