More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0103 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  51.14 
 
 
189 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  47.78 
 
 
183 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  47.22 
 
 
183 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  45.88 
 
 
195 aa  148  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  43.53 
 
 
172 aa  137  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  40.7 
 
 
199 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  38.76 
 
 
187 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  41.52 
 
 
200 aa  127  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  38.18 
 
 
193 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  41.42 
 
 
172 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  36.05 
 
 
179 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  35.67 
 
 
171 aa  111  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  32.75 
 
 
174 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  36.14 
 
 
176 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  34.09 
 
 
203 aa  106  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  35.2 
 
 
184 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0104  Chromate transporter  34.59 
 
 
186 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000372126  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  42.76 
 
 
187 aa  101  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  40.44 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  33.9 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1606  Chromate transporter  47.5 
 
 
183 aa  94  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3495  Chromate transporter  35.56 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  34.29 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  39.69 
 
 
192 aa  91.3  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  35.76 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  33.53 
 
 
420 aa  90.9  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  33.85 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  32.56 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  30.23 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  32.56 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  36.67 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  33.15 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  29.76 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  31.62 
 
 
432 aa  84.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  33.71 
 
 
188 aa  84.3  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.77 
 
 
174 aa  84.3  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  31.89 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  30.86 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0233  Chromate transporter  39.85 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  29.82 
 
 
416 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0357  chromate transporter  29.7 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.925171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.67 
 
 
417 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1126  Chromate transporter  31.95 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  25.75 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  28.81 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.77 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  28.08 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.61 
 
 
404 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.54 
 
 
382 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.77 
 
 
443 aa  77.8  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  34.17 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.09 
 
 
387 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  31.14 
 
 
403 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2508  chromate transport protein  38.76 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2214  chromate transporter  38.76 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.707988  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  34.71 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.08 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.7 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  41.76 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.65 
 
 
446 aa  75.1  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2840  Chromate transporter  30.73 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  32.16 
 
 
450 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.4 
 
 
386 aa  74.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  31.68 
 
 
409 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  27.06 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.88 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  29.7 
 
 
401 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.28 
 
 
389 aa  72  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  27.81 
 
 
483 aa  72.4  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  30.64 
 
 
407 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  30.64 
 
 
407 aa  72  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  26.88 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  24.57 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  32.11 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  25.73 
 
 
456 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  26.88 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  29.7 
 
 
401 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  29.7 
 
 
401 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  25.58 
 
 
431 aa  70.9  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  29.7 
 
 
401 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  29.7 
 
 
401 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2736  Chromate transporter  29.88 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.7368  normal  0.214658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  37.74 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  29.76 
 
 
408 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.3 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  37.74 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2841  Chromate transporter  30.23 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000452935  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  25.93 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.33 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.24 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.26 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  25.73 
 
 
453 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.01 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  25.15 
 
 
456 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.74 
 
 
469 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.13 
 
 
391 aa  68.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  28.31 
 
 
393 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>