More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3737 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  100 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  67.2 
 
 		 208 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  38.79 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  38.07 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  36.46 
 
 		 190 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  38.32 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  38.32 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  38.32 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  38.92 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.81 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37.04 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  35.56 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.37 
 
 		 415 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.52 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  36.59 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  41.18 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  34.41 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  32.95 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  41.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  41.18 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  34.38 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  34.38 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  34.38 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.89 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  43.81 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  32.93 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  37.35 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  36.32 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  32.14 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  34.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.5 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  42.31 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  33.13 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  34.12 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  38.46 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  24.47 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  31.68 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  34.78 
 
 		 450 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  34.66 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.97 
 
 		 386 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  34.86 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  34.86 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  34.04 
 
 		 420 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  34.39 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  32.96 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  35.76 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  41.28 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  38.02 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  32.56 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  36.17 
 
 		 418 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.49 
 
 		 396 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.89 
 
 		 397 aa  71.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.57 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  29.21 
 
 		 493 aa  71.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.04 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.52 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  35 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28.32 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  28.48 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.21 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  30.81 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  29.51 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  30.81 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  33.77 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  35.07 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  21.2 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  31.65 
 
 		 431 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.45 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.45 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.9 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.45 
 
 		 396 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.26 
 
 		 467 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.71 
 
 		 441 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  27.98 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  35.23 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.34 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  34.62 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  34.62 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  30.36 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  31.98 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  38.78 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  30.68 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  25.43 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  25.34 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  36.51 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  31.55 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  29.53 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.56 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  32 
 
 		 394 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  27.78 
 
 		 383 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  29.05 
 
 		 467 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  33.94 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  24.57 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  23.5 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  36.96 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.5 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.25 
 
 		 404 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  37.25 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  35.92 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  35.1 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>