More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3786 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  100 
 
 
196 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  69.35 
 
 
203 aa  264  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  71.35 
 
 
202 aa  251  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  71.5 
 
 
202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  68.25 
 
 
198 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  65.78 
 
 
196 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  68.65 
 
 
191 aa  236  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  64.48 
 
 
199 aa  222  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  68.11 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  59.78 
 
 
196 aa  197  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  56.5 
 
 
209 aa  188  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  63.07 
 
 
233 aa  184  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  40.78 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  44.27 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  46.55 
 
 
192 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  45.26 
 
 
193 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  41.57 
 
 
187 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.75 
 
 
185 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  48.8 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  42.29 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  44.26 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  40.24 
 
 
198 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  39.24 
 
 
198 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  41.14 
 
 
215 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  36.52 
 
 
189 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.13 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  38.29 
 
 
199 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  39.43 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  39.43 
 
 
199 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  39.66 
 
 
199 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  39.66 
 
 
199 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  39.66 
 
 
199 aa  98.2  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  40.12 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.84 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  37.04 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  36.21 
 
 
204 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  38.27 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  43.12 
 
 
361 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  38.61 
 
 
212 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  42.77 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  33.33 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  37.62 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  37.62 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  37.62 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.36 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.56 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  34.44 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  32.16 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  34.48 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  30.28 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.58 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.3 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  33.72 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  33.72 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  38.46 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.14 
 
 
382 aa  74.7  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  28.65 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.66 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  32.77 
 
 
416 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.12 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.36 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.73 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  26.43 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  30.66 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  34.11 
 
 
385 aa  68.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  24.71 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.77 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  31.33 
 
 
394 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  25.58 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.56 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  28.15 
 
 
393 aa  64.7  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  31.48 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.63 
 
 
420 aa  64.7  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.09 
 
 
383 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.8 
 
 
390 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.74 
 
 
400 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  38.1 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.62 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.73 
 
 
454 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  31.62 
 
 
396 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.62 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  36.84 
 
 
396 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.59 
 
 
415 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  31.12 
 
 
399 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  31.62 
 
 
396 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  31.97 
 
 
483 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  30.57 
 
 
401 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  28.26 
 
 
390 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  28.26 
 
 
390 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.85 
 
 
396 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  36.94 
 
 
392 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  29.17 
 
 
154 aa  62.4  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  28.28 
 
 
401 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.5 
 
 
397 aa  61.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  30.77 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.75 
 
 
386 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.21 
 
 
352 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  28.27 
 
 
401 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  32.09 
 
 
462 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.61 
 
 
469 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>