More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4177 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  100 
 
 
208 aa  410  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  67.2 
 
 
197 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.33 
 
 
415 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.59 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.59 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  40 
 
 
185 aa  95.5  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  34.55 
 
 
178 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  39.43 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  37.87 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  37.87 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  37.87 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  35.75 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  34.9 
 
 
204 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  30.77 
 
 
190 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  35.87 
 
 
198 aa  89.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  37.59 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  32.74 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  29.61 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  38.1 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  33.52 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  35.44 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.48 
 
 
202 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.18 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.18 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  30.06 
 
 
185 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  36.36 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  35.09 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  33.7 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  30.98 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.35 
 
 
199 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  35.39 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  35.39 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  28.72 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  35.23 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  31.18 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  35.67 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  30.93 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  31.43 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  32.81 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  26.15 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  32.8 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  35.34 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  31.82 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  37.35 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.2 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  34.46 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  37.5 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  27.54 
 
 
450 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.3 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  34.78 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  35.33 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  35.45 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  35.71 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  36.36 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  34.21 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  39.39 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.03 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  24.34 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  32.97 
 
 
361 aa  72  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  27.98 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  31.52 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  32.47 
 
 
408 aa  71.6  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  29.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  29.89 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.17 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.89 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.89 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  39.09 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  39.09 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.96 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  29.49 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  32.26 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  35.45 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  34.82 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.89 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  29.45 
 
 
392 aa  69.3  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.91 
 
 
441 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.17 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.57 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.76 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  28.49 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.04 
 
 
418 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  33.64 
 
 
418 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  33.04 
 
 
418 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  31.61 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  31.61 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  31.61 
 
 
390 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.71 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  29.66 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.41 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.62 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.21 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  33.04 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.1 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.45 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.58 
 
 
418 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  27.74 
 
 
385 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.77 
 
 
154 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>