More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3495 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  98.56 
 
 
418 aa  814    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  98.56 
 
 
418 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  100 
 
 
418 aa  828    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  97.9 
 
 
382 aa  686    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  84.96 
 
 
383 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  79.42 
 
 
390 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  79.95 
 
 
390 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  79.68 
 
 
390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  80.21 
 
 
390 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  66.14 
 
 
383 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  64.38 
 
 
395 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  64.77 
 
 
386 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  61.64 
 
 
383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  54.74 
 
 
383 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  58.31 
 
 
381 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  55.15 
 
 
378 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  53.21 
 
 
402 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  55.12 
 
 
390 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  56.46 
 
 
379 aa  343  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  53.3 
 
 
380 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  53.09 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  45.1 
 
 
404 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  44.18 
 
 
401 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  44.18 
 
 
401 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  44.18 
 
 
401 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  44.73 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  44.18 
 
 
401 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  43.78 
 
 
402 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  41.45 
 
 
403 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.88 
 
 
415 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  44.18 
 
 
401 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.86 
 
 
407 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  42.09 
 
 
388 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  44.39 
 
 
412 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  44.56 
 
 
413 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  43.9 
 
 
397 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  40.97 
 
 
425 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  43.11 
 
 
408 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  40.37 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  43.93 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  41.96 
 
 
403 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  41.88 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.88 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.56 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.56 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  41.95 
 
 
393 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  44.83 
 
 
401 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  43.5 
 
 
417 aa  232  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  41.16 
 
 
393 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  40.58 
 
 
393 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  41.69 
 
 
393 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.95 
 
 
411 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.95 
 
 
411 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  41.36 
 
 
393 aa  229  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  41.69 
 
 
393 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.42 
 
 
391 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  40.2 
 
 
403 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  40.97 
 
 
403 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.21 
 
 
405 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  42.59 
 
 
411 aa  226  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  40.71 
 
 
403 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  44.42 
 
 
412 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.29 
 
 
443 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  41.36 
 
 
393 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  39.57 
 
 
430 aa  225  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  41.16 
 
 
401 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  43.62 
 
 
430 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.67 
 
 
400 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  42.56 
 
 
408 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  43.04 
 
 
398 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  42.67 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  42.67 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  39.89 
 
 
392 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  41.73 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  42.11 
 
 
409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.15 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  42.97 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  39.84 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.07 
 
 
407 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  42.89 
 
 
405 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  44.41 
 
 
387 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  40.36 
 
 
404 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  40 
 
 
394 aa  203  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.66 
 
 
403 aa  202  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  42.02 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  43.69 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.44 
 
 
411 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.66 
 
 
407 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  40.61 
 
 
426 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.05 
 
 
404 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  43.47 
 
 
416 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  37.39 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.6 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.97 
 
 
404 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.24 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  28.16 
 
 
382 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  47.97 
 
 
158 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.53 
 
 
379 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  27.19 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.98 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>