231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0956 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  100 
 
 		 196 aa  363  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.01 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.63 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  36.67 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  46.23 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  33.51 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  36.59 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  36.91 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  36.53 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  34.3 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  42.86 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  35.35 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  32.99 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.97 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  37.16 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  35.59 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  37.16 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  36.08 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  37.3 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  34.5 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  36.77 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  40.59 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  36.77 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  36.77 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  39 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  36.77 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28.65 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  35.23 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  36.77 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  36.77 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  39.8 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  42.68 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.14 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  32.58 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  34.38 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  34.05 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  34.05 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  30.52 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  39.81 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  33.33 
 
 		 428 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  34.19 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  38.46 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.75 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  34.78 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  42.71 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  39.8 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.37 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  28.93 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  38.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  25.43 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  38.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  27.37 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  38.78 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  37.23 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  27.53 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.08 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1752  Chromate transporter  34.62 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  33.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  25.16 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  39.19 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  29.88 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.85 
 
 		 465 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  25.14 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.43 
 
 		 416 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  37.5 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  32.06 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  34.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  34.38 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  29.34 
 
 		 483 aa  54.7  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  33.12 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  34.12 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  37.07 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.25 
 
 		 469 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  25.38 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  26.16 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  41.67 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  38.27 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  26.92 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  25.15 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1104  chromate transporter  34.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.590576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  22.86 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  30.61 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.41 
 
 		 472 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.41 
 
 		 472 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1002  chromate transporter  34.82 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.815212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1103  chromate transporter  38.36 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.295774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1003  chromate transporter  38.36 
 
 		 166 aa  51.2  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  30.5 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  31.19 
 
 		 467 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  32.28 
 
 		 460 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  40 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.97 
 
 		 415 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  31.87 
 
 		 387 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  32.31 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.38 
 
 		 469 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0103  Chromate transporter  25 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000375668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.86 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.83 
 
 		 382 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  24.85 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  32.61 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>