More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1522 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  100 
 
 
188 aa  367  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  45.25 
 
 
185 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  61.15 
 
 
195 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  44.13 
 
 
193 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  40.23 
 
 
192 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  40.23 
 
 
192 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  43.37 
 
 
193 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  41.38 
 
 
198 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  41.52 
 
 
198 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  39.47 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  45 
 
 
196 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.66 
 
 
189 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  40.24 
 
 
187 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  38.26 
 
 
178 aa  121  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  38.95 
 
 
189 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  42.5 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  44.26 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  39.18 
 
 
212 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  37.57 
 
 
204 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  42.59 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.24 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  37.04 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.24 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.24 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  39.18 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  40.22 
 
 
199 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  40.24 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.24 
 
 
199 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.24 
 
 
199 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  40.24 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.35 
 
 
203 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  37.28 
 
 
185 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  41.53 
 
 
202 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  41.53 
 
 
202 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  38.37 
 
 
226 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  38.37 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  39.88 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  38.37 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  35.67 
 
 
190 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  44.88 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  39.88 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  40.68 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  42.98 
 
 
361 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  37.04 
 
 
428 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  36.36 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  40.23 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  42.48 
 
 
233 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  30.18 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  31.9 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  36.65 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  33.33 
 
 
214 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  37.42 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.17 
 
 
420 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.77 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.77 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  36.77 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  30.46 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.25 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  28.67 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  29.8 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  36.51 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.03 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  31.17 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.97 
 
 
352 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  33.56 
 
 
401 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  31.54 
 
 
483 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  34.29 
 
 
396 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.15 
 
 
415 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  27.08 
 
 
376 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  34.75 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.88 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.21 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  30.72 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  32.21 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.04 
 
 
390 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.21 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  35 
 
 
450 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.04 
 
 
390 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  33.57 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  33.57 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.59 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  32.37 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.07 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  32.59 
 
 
401 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  33.76 
 
 
431 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  32.11 
 
 
378 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.03 
 
 
385 aa  65.1  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  31.08 
 
 
416 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  33.33 
 
 
392 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.42 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  27.41 
 
 
379 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  33.57 
 
 
393 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  32 
 
 
403 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  30.14 
 
 
454 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  30.14 
 
 
454 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  31.88 
 
 
378 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  32.62 
 
 
392 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.85 
 
 
389 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  32 
 
 
403 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  31.62 
 
 
376 aa  62.8  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>