More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3056 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  100 
 
 		 204 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  98.04 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  96.61 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  96.61 
 
 		 226 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  95 
 
 		 226 aa  271  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  88.78 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  87.56 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  79.03 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  79.03 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  78.38 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  77.96 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  77.96 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  77.96 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  81.98 
 
 		 185 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  70.88 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  72.78 
 
 		 189 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  71.35 
 
 		 202 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  60.9 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  59.66 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  51.98 
 
 		 361 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  43.43 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  47.67 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  44.56 
 
 		 192 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  39.05 
 
 		 178 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  44.51 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  45.06 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  40.88 
 
 		 185 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  40.74 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  45.83 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  38.73 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.57 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  44.38 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  37.57 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  41.76 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  36.84 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  34.9 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  36.02 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  40.7 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  38.86 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.21 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  37.93 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  34.04 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  35.26 
 
 		 190 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  38.92 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  34.66 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  38.34 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  40.11 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  37.11 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  39.77 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  39.77 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  32.47 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  39.39 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.03 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  36.32 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  43.83 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.53 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  31.72 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  34.23 
 
 		 450 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  30.17 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  26.01 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  42 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  36.18 
 
 		 460 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.7 
 
 		 428 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  32.18 
 
 		 449 aa  71.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.32 
 
 		 405 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  43.37 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  31.46 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  30.72 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  35.71 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  34.2 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.87 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.93 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  40.91 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  25.41 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  29.87 
 
 		 443 aa  68.6  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  40.16 
 
 		 430 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  35 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  40.54 
 
 		 407 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  31.46 
 
 		 456 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  27.93 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.47 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.74 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  41 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  24.34 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  32.1 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.56 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.64 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  39.64 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  28.99 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  32.17 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.56 
 
 		 469 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  39.39 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  28.68 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  40 
 
 		 403 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  41.67 
 
 		 417 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  27.86 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  40.57 
 
 		 401 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  33.52 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.67 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>