More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0294 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  100 
 
 
199 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  100 
 
 
199 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  98.49 
 
 
199 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  98.49 
 
 
199 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  98.49 
 
 
199 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  99.46 
 
 
185 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  94.57 
 
 
199 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  80.11 
 
 
204 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  79.03 
 
 
204 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  81.67 
 
 
208 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  75.72 
 
 
189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  73.22 
 
 
189 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  76.04 
 
 
212 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  81.03 
 
 
226 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  81.03 
 
 
226 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  81.4 
 
 
226 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  67.39 
 
 
202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  60.26 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  59.76 
 
 
199 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  44.51 
 
 
198 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  46.24 
 
 
187 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  50.89 
 
 
361 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  43.93 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  43.93 
 
 
192 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  44.12 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  36.93 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  46.3 
 
 
196 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  45.4 
 
 
193 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  43.86 
 
 
193 aa  121  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  37.63 
 
 
198 aa  121  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  42.24 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  40.83 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  40.59 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  40.24 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  38.66 
 
 
190 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  43.45 
 
 
209 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  39.43 
 
 
196 aa  105  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  40.83 
 
 
199 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  38.46 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  40.57 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  39.75 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  40.99 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  33.85 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  36.27 
 
 
190 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  41.32 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  40.12 
 
 
203 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  39.33 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  39.41 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  39.41 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37.5 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  37.7 
 
 
202 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  41.36 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  29.81 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.04 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.11 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  44.59 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.76 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.11 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  38.06 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  25.95 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  33.13 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  39.13 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  33.78 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  31.11 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.25 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0358  chromate transporter  26.75 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28.39 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  26.59 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0648  chromate transporter  32.21 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  34.44 
 
 
401 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  29.73 
 
 
443 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  39.25 
 
 
430 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  23.67 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  31.25 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  38.58 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  31.58 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  38.18 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  34.44 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  28.39 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  29.56 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  44.21 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.9 
 
 
467 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  31.82 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  39.56 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  27.03 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.03 
 
 
441 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  33.99 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.23 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.67 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  42.7 
 
 
403 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  26.13 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  36.84 
 
 
392 aa  64.7  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  38.89 
 
 
413 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  39.62 
 
 
401 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.67 
 
 
383 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  30.81 
 
 
453 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  40.45 
 
 
401 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  26.67 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  40.45 
 
 
401 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  40.45 
 
 
401 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>