More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4012 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  64.44 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  45.93 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  43.9 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  42.31 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  42.26 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  42.78 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  43.45 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  43.33 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  43.5 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  43.32 
 
 		 361 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  42.33 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.28 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  43.82 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  43.82 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  43.82 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  44.02 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  41.01 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  43.48 
 
 		 204 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  43.26 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  40.78 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  43.26 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  44.51 
 
 		 185 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  46.11 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  42.7 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  44.32 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  39.62 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  38.12 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  39.55 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  42.94 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  43.75 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  40 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  39.52 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  43.75 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  43.75 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  42.5 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  40.26 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  43.89 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  44.64 
 
 		 202 aa  104  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  38.07 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  40.64 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  39.68 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  35.56 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  38.95 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.5 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  38.76 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  38.96 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.43 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  38.58 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  30.81 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.63 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  35.23 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.32 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  33.82 
 
 		 450 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  33.73 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  33.73 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.46 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.49 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  32.8 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.11 
 
 		 416 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  37 
 
 		 408 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  29.46 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.99 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  31.15 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  27.37 
 
 		 428 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  33.92 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  36.47 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.16 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  36.55 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  28.38 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.29 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  26.86 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  26.86 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.1 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  37.63 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.49 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  26.63 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.14 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  33.33 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  29.03 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  29.38 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  25.47 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  25.61 
 
 		 189 aa  62  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  36.27 
 
 		 404 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.04 
 
 		 405 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  22.86 
 
 		 443 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.08 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  31.03 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  27.45 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.19 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.9 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.15 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  27.61 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  30.15 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.74 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  27.84 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  31.2 
 
 		 392 aa  59.3  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  26.8 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.85 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>