More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4416 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  100 
 
 
202 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  78.31 
 
 
189 aa  272  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  77.42 
 
 
189 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  74.32 
 
 
204 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  71.35 
 
 
204 aa  227  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  67.39 
 
 
199 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  67.39 
 
 
199 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  74.86 
 
 
208 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  67.39 
 
 
185 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  70.69 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  67.96 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  67.96 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  67.96 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  77.84 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  77.38 
 
 
226 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  77.38 
 
 
226 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  77.38 
 
 
226 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  58.24 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  55.92 
 
 
199 aa  161  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.89 
 
 
185 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  44.02 
 
 
193 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  45.73 
 
 
198 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  44.05 
 
 
192 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  44.05 
 
 
192 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  46.11 
 
 
361 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  39.47 
 
 
188 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  43.86 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  39.18 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  38.8 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  36.21 
 
 
178 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  38.82 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  41.95 
 
 
196 aa  122  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  36.78 
 
 
203 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  45.75 
 
 
209 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  38.59 
 
 
198 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  35.11 
 
 
199 aa  104  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  35.84 
 
 
196 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.37 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  37.17 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  37.35 
 
 
208 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  37.64 
 
 
203 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  33.73 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  35.76 
 
 
202 aa  94  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  35.09 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  35.91 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  35.36 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  36.14 
 
 
202 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  35.36 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.79 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.78 
 
 
214 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  32.76 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  36.48 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  38.12 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  28.12 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  41.84 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  32.48 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  40.16 
 
 
417 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  29.94 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  47.37 
 
 
407 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.5 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  23.98 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  34.32 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  30.71 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  30.28 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  33.93 
 
 
425 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  37.38 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  35.83 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  33.85 
 
 
450 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.34 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.66 
 
 
396 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.34 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  23.66 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.15 
 
 
441 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  42.86 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  37.5 
 
 
430 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  44.57 
 
 
413 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  37.19 
 
 
408 aa  65.5  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.71 
 
 
443 aa  65.1  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.21 
 
 
407 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  34.29 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  34.29 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  36.13 
 
 
402 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.75 
 
 
400 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  34.29 
 
 
396 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  37.07 
 
 
403 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  37.19 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  38.02 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  26.5 
 
 
456 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  34.29 
 
 
396 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  34.29 
 
 
396 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  33.06 
 
 
432 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  40.66 
 
 
401 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  40.43 
 
 
392 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  29.52 
 
 
483 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  40.66 
 
 
401 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  40.66 
 
 
401 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.59 
 
 
449 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  37.93 
 
 
403 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  38.79 
 
 
403 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>