More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0381 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  58.79 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  56.48 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  60.23 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  62.94 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  59.66 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  61.59 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  56.9 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  58.72 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  62.94 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  58.72 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  58.72 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  58.14 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  58.14 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  58.14 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  65.29 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  61.99 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  61.99 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  61.99 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  46.93 
 
 		 361 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  45.96 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  41.76 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  43.53 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  40.78 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  42.94 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  41.52 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40.23 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  42.33 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  41.52 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  45.1 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  40.68 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  39.33 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  36.63 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  36.22 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  36.51 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  36 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  35.83 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.02 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  36.51 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  36.9 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  34.07 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  34.1 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.29 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  33.99 
 
 		 190 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  36.69 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  35.47 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  35.5 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  35.5 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  37.8 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  35.03 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  30.91 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  31.36 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.69 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.42 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  31.58 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  29.14 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  34.46 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.33 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  34.94 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.67 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  32.09 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  28.38 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.73 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  25.79 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.09 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  30.12 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.98 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  27.54 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.2 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  25.3 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  33.1 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  46.24 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  35.24 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.97 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.39 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  25.75 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  33.11 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  35 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.66 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.94 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  35.59 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  35.83 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.26 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.03 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.46 
 
 		 483 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  29.79 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  43.88 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.57 
 
 		 450 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  26.67 
 
 		 456 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  35 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  35 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  35 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  31.47 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  31.47 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  34.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  34.38 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  27.51 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  26.67 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  38.21 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  28.18 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>