More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2259 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  100 
 
 
202 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  96.04 
 
 
202 aa  348  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  69.47 
 
 
203 aa  265  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  71.5 
 
 
196 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  67.54 
 
 
198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  59.59 
 
 
196 aa  228  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  60.54 
 
 
191 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  61.41 
 
 
199 aa  208  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  59.36 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  57.38 
 
 
209 aa  194  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  58.29 
 
 
201 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  58.52 
 
 
233 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  37.93 
 
 
178 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  41.62 
 
 
192 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  41.15 
 
 
198 aa  121  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  41.04 
 
 
192 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  43.75 
 
 
185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  42.56 
 
 
193 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  46.01 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  38.17 
 
 
187 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  39.77 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  41.53 
 
 
188 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.52 
 
 
185 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  40.78 
 
 
190 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  39.9 
 
 
361 aa  95.9  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  39.13 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  41.03 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  41.77 
 
 
215 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  36.52 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  37.11 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.37 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  40 
 
 
204 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  41.32 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  41.32 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  41.32 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  39.41 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  42.95 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  36.14 
 
 
202 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  41.46 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  41.32 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  41.32 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  42.45 
 
 
212 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  42.16 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  41.51 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  41.51 
 
 
226 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  36.46 
 
 
197 aa  84.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  35.37 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  40.24 
 
 
195 aa  82  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  34.07 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  31.61 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  39.55 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  34.36 
 
 
454 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  35.33 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  34.29 
 
 
447 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.52 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  32.18 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  32.18 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  32.76 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.63 
 
 
456 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  40.3 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  30.57 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.54 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  27.87 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  29.61 
 
 
454 aa  72  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.13 
 
 
456 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  31.58 
 
 
444 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  34.78 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  31.67 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  30.34 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  33.59 
 
 
385 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  33.1 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.38 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  37 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  33.75 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.05 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  31.28 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  31.28 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  32.12 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  32.12 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  31.93 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.16 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  28.57 
 
 
483 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.51 
 
 
392 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.83 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  32.84 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  30.05 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  29.38 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  30.49 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  28.47 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  30.49 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  29.3 
 
 
452 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.73 
 
 
415 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  27.53 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  29.65 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  32.82 
 
 
390 aa  65.9  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  34.88 
 
 
378 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.46 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  30.15 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.33 
 
 
416 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  32.96 
 
 
431 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>