More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1914 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  100 
 
 
361 aa  689    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  52 
 
 
204 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  51.4 
 
 
204 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  41.57 
 
 
178 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  45.6 
 
 
189 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  46.11 
 
 
202 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  44.58 
 
 
198 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  50.89 
 
 
199 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  50.89 
 
 
199 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  50.89 
 
 
185 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  48.55 
 
 
199 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  45.9 
 
 
189 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  51.18 
 
 
212 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  52.35 
 
 
208 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  50.3 
 
 
199 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  50.3 
 
 
199 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  50.3 
 
 
199 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  48.26 
 
 
193 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  52.17 
 
 
187 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  43.65 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  51.45 
 
 
226 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  51.45 
 
 
226 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  51.45 
 
 
226 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  43.43 
 
 
192 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  44.44 
 
 
192 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  46.93 
 
 
199 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  42.13 
 
 
185 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  53.72 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  46.47 
 
 
215 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.5 
 
 
203 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  39.76 
 
 
196 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  38.17 
 
 
185 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  42.29 
 
 
193 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  40.11 
 
 
199 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  39.9 
 
 
202 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  42.67 
 
 
191 aa  97.8  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  43.67 
 
 
198 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  41.11 
 
 
202 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  34.12 
 
 
197 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  37.91 
 
 
196 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  32.97 
 
 
208 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  37.22 
 
 
196 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  44.23 
 
 
188 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  33.74 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  37.88 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  46.9 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  41.36 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  39.43 
 
 
233 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  30.27 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  42.98 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  38.6 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.65 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.16 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  29.79 
 
 
188 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  29.79 
 
 
188 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.13 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  38.6 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  39.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  30.39 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.21 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  38.61 
 
 
214 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  34.67 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.79 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  31.21 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  39.18 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  39.18 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  39.47 
 
 
392 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  29.19 
 
 
203 aa  62.8  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.96 
 
 
404 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  30.49 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.43 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  39.22 
 
 
396 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  40.37 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.67 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  38.53 
 
 
417 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  34.53 
 
 
188 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.94 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.6 
 
 
400 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  37.39 
 
 
450 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  38.05 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  38.53 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  36.67 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.83 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.12 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.83 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  32.93 
 
 
463 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  25.2 
 
 
183 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  38.36 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  44.94 
 
 
407 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  37.61 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.58 
 
 
469 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  29.91 
 
 
154 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  25.2 
 
 
183 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.75 
 
 
441 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  38.53 
 
 
403 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  29.85 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  38.53 
 
 
403 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>