More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6357 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  100 
 
 
212 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  86.32 
 
 
204 aa  304  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  85.85 
 
 
204 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  88.54 
 
 
208 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  87.75 
 
 
226 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  86.47 
 
 
226 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  86.47 
 
 
226 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  72.6 
 
 
199 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  72.6 
 
 
199 aa  255  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  77.66 
 
 
199 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  73.74 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  76.6 
 
 
185 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  73.74 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  73.74 
 
 
199 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  70.9 
 
 
189 aa  240  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  70.21 
 
 
189 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  71.28 
 
 
202 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  62.42 
 
 
215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  61.33 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  51.12 
 
 
361 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  44.57 
 
 
198 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  42.93 
 
 
192 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  46.5 
 
 
187 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  38.1 
 
 
178 aa  131  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  45.61 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  42.39 
 
 
185 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  41.71 
 
 
185 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  36.98 
 
 
198 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  42.86 
 
 
196 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  45.51 
 
 
193 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  42.08 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  37.71 
 
 
203 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  37.84 
 
 
188 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  42.7 
 
 
209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  37.11 
 
 
208 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  41.18 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  38.51 
 
 
199 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  36.46 
 
 
196 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.08 
 
 
196 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  40.11 
 
 
198 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  40 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  35.05 
 
 
190 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  34.78 
 
 
191 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  37.7 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  33.76 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  40.23 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  37.17 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  36.65 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  36.65 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  32.96 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  35 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.53 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  43.64 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  36.36 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.84 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.04 
 
 
441 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.17 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  36.25 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.13 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  31.58 
 
 
450 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  28.07 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  31.19 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.64 
 
 
405 aa  72  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  31.72 
 
 
383 aa  71.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  41.28 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  25 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  26.63 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  29.93 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  42.57 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.55 
 
 
428 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  28.83 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  26.94 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  41.76 
 
 
412 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  41.28 
 
 
407 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1903  chromate transporter  34.13 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  28.06 
 
 
442 aa  68.6  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  33.14 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  31.18 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  28 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.29 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  32.32 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.13 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  27.03 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  44.09 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  46.15 
 
 
388 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.37 
 
 
407 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  30.51 
 
 
453 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.72 
 
 
428 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32 
 
 
467 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  33.57 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  29.94 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1094  chromate transporter  24.6 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  30.86 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  43.3 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  39.82 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  32.94 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  28.46 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1127  Chromate transporter  27.92 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  42.06 
 
 
403 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>