More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2051 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  100 
 
 
190 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  90 
 
 
190 aa  320  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  43.27 
 
 
203 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  45.25 
 
 
202 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  43.27 
 
 
203 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  43.27 
 
 
203 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  43.27 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  45.18 
 
 
214 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  38.92 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  39.61 
 
 
192 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40.26 
 
 
198 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  38.07 
 
 
197 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  37.06 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  35.93 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  37.34 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  35.71 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  38.66 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  38.66 
 
 
199 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  36.84 
 
 
204 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  38.25 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  38.25 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  38.25 
 
 
199 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  38.46 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  33.79 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  39.77 
 
 
185 aa  91.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  30.77 
 
 
208 aa  91.7  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  36.32 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  37.63 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  32.05 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  33.14 
 
 
187 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  38.86 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  38.04 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  36.42 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  37.04 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  38.46 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  35.67 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  26.4 
 
 
199 aa  85.1  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  35.84 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  40.78 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  40.78 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  31.89 
 
 
443 aa  82  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  38.42 
 
 
226 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  38.42 
 
 
226 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.41 
 
 
382 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  38.07 
 
 
390 aa  81.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.77 
 
 
397 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  30.18 
 
 
394 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  37.13 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.82 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  38.07 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  33.81 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  33.81 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  36.75 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  30.41 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  27.49 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.42 
 
 
428 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  36.93 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.09 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  35.96 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  33.09 
 
 
390 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  30.86 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0192  Chromate transporter  31.65 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2732  chromate transporter  30.82 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  35.39 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  33.33 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  26.82 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.07 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  26.82 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.5 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.5 
 
 
396 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.5 
 
 
396 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  32.06 
 
 
393 aa  75.1  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  26.78 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0714  Chromate transporter  31.32 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.9 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.12 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  34.36 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  28.26 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  30.17 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.47 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.68 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.17 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  25.7 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.61 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.23 
 
 
392 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  31.21 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  25.57 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.33 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0727  Chromate transporter  34.75 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000305738 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  30.91 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  25.7 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.95 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  27.01 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.81 
 
 
400 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1743  chromate transport protein  30.83 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  34.23 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  33.33 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  31.94 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  30.67 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  33.33 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>