More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4042 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  100 
 
 
203 aa  390  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  93.53 
 
 
203 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  93.53 
 
 
203 aa  310  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  92.54 
 
 
203 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  83.17 
 
 
202 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  66.67 
 
 
214 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  43.27 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  40.35 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  38.32 
 
 
197 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  33.17 
 
 
208 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  38.64 
 
 
185 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  35.23 
 
 
199 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  36.56 
 
 
203 aa  101  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  37.7 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  36.13 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  41.42 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  35.86 
 
 
196 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  35.2 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  37.11 
 
 
196 aa  94.7  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  37.43 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  36.9 
 
 
193 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  39.89 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  33.73 
 
 
178 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  39.89 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  39.89 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  35.47 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  37.37 
 
 
202 aa  91.3  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  39.89 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  34.04 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  38.54 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  40.21 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  38.54 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  40.11 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  40.21 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  35.23 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  34.2 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  36.99 
 
 
193 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  33.51 
 
 
191 aa  87  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  41.21 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  39.43 
 
 
185 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  39.89 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  36.18 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  37.27 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  38.46 
 
 
187 aa  82  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  35.1 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.83 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.11 
 
 
415 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  27.37 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  34.22 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.21 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  41.18 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  31.1 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  41.18 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  41.18 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.5 
 
 
405 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  34.29 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  25.75 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  38.33 
 
 
361 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  37.39 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0053  Chromate transporter  40.66 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.71 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.31 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  38.2 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  40.86 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  29.53 
 
 
449 aa  68.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.95 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.61 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  40 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  39.58 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  29.3 
 
 
386 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  39.78 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  41.18 
 
 
412 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  35.64 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.98 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  36.46 
 
 
401 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  37 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  33.33 
 
 
385 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.82 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  29.19 
 
 
401 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.71 
 
 
407 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  34.82 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.46 
 
 
400 aa  64.7  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  30.07 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  27.72 
 
 
383 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  38.3 
 
 
408 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  37.96 
 
 
392 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2508  chromate transporter  31.01 
 
 
450 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  39.33 
 
 
403 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  30.38 
 
 
379 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.82 
 
 
483 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  35.19 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  31.58 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  40.17 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  38.2 
 
 
401 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.94 
 
 
383 aa  62.4  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  38.2 
 
 
401 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  38.2 
 
 
401 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.74 
 
 
404 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  25.44 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  37.74 
 
 
233 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>