More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0936 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  100 
 
 
386 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  74.74 
 
 
395 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  62.44 
 
 
383 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  62.83 
 
 
390 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  61.92 
 
 
383 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  63.57 
 
 
383 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  63.87 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  63.61 
 
 
390 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  63.61 
 
 
390 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.77 
 
 
418 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  64.77 
 
 
418 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  64.77 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  64.51 
 
 
382 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  55.73 
 
 
383 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  54.29 
 
 
378 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  54.17 
 
 
390 aa  358  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  55.43 
 
 
380 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  54.43 
 
 
402 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  56.59 
 
 
381 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  54.15 
 
 
379 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  51.3 
 
 
387 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  45.48 
 
 
404 aa  281  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  43.78 
 
 
412 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.9 
 
 
407 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.29 
 
 
415 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  40.87 
 
 
393 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  42.86 
 
 
388 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  43.53 
 
 
402 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  43.04 
 
 
393 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  42.3 
 
 
425 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  42.42 
 
 
403 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  43.09 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  43.09 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  43.09 
 
 
401 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  42.16 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  42.78 
 
 
393 aa  245  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  40.98 
 
 
393 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.9 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  42.01 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  42.42 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  46.56 
 
 
430 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  44.44 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.88 
 
 
408 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.88 
 
 
408 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  41.9 
 
 
393 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.49 
 
 
405 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  43.3 
 
 
401 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  45.5 
 
 
417 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  42.01 
 
 
393 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.33 
 
 
391 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  41.92 
 
 
397 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  43.09 
 
 
401 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  42.08 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  43.09 
 
 
401 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  42.09 
 
 
392 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  45.89 
 
 
401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  42.82 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  41.38 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  44.92 
 
 
408 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  39.53 
 
 
403 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  41.24 
 
 
430 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  41.9 
 
 
408 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  44.5 
 
 
407 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  44.5 
 
 
407 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.99 
 
 
403 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.75 
 
 
443 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  43.32 
 
 
405 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.97 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.97 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  41.36 
 
 
401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  40.82 
 
 
392 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  40.9 
 
 
403 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  43.65 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  41 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.69 
 
 
400 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  39.44 
 
 
396 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  42.89 
 
 
409 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  41.13 
 
 
403 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  42.28 
 
 
404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  40.9 
 
 
412 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.7 
 
 
407 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  39.75 
 
 
394 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  39.69 
 
 
394 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1287  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.4 
 
 
411 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  38.7 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  42.75 
 
 
426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  40.39 
 
 
387 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  42.99 
 
 
346 aa  193  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1023  chromate transporter  44.53 
 
 
398 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2035  chromate transporter  42.42 
 
 
407 aa  190  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118993  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.29 
 
 
404 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  41.67 
 
 
416 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  29.09 
 
 
493 aa  143  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  37.16 
 
 
330 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2507  Chromate transporter  51.35 
 
 
158 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.87 
 
 
404 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.6 
 
 
397 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.73 
 
 
386 aa  123  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  28.93 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.08 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>