More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2215 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  65.78 
 
 		 196 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  59.04 
 
 		 203 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  59.8 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  59.59 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  64.09 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  59.39 
 
 		 198 aa  217  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  61.5 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  65.75 
 
 		 201 aa  202  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  55.43 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  50.56 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  57.65 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  39.77 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  51.18 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  41.34 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  41.51 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  36.84 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  43.82 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  44 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  39.76 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  42.59 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  41.38 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  36.63 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  39.53 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.37 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.37 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.37 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.37 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  36.9 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  34.57 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  39.75 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  39.75 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  40.26 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  34.04 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  35.52 
 
 		 197 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  33.69 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  36.25 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  42.73 
 
 		 361 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  41 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.38 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  35.62 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  36.57 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  34.88 
 
 		 212 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  37.3 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  39 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  39 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  39 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  36.05 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  35.47 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  35.47 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  34.64 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  34.3 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  42.45 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  29.34 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  33.85 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.72 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  30.05 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  29.93 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1607  Chromate transporter  30.22 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  35.07 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  29.08 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  28.92 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  34.59 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.38 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  29.3 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  32.32 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.14 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  28.42 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  29.38 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.07 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  30.48 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.66 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.69 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  31.9 
 
 		 393 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  28.99 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  28.22 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  28.22 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.22 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.22 
 
 		 396 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.22 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  27.61 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  33.33 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  30.89 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  33.33 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  38.46 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  31.9 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.22 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.22 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0232  Chromate transporter  28.18 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  31.86 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  33.33 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.57 
 
 		 397 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  30.25 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  29.09 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.21 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  27.41 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  33.33 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  27.17 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  34.31 
 
 		 403 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  31.76 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>